source: trunk/src/get_file_info.m @ 946

Last change on this file since 946 was 946, checked in by sommeria, 5 years ago

read hf5 added

File size: 6.6 KB
Line 
1%'get_file_info': determine info about a file (image, multimage, civdata,...) .
2%------------------------------------------------------------------------
3% [FileInfo,VideoObject]=get_file_info(fileinput)
4%
5% OUTPUT:
6% FileInfo: structure containing info on the file (case of images or video), in particular
7%      .FileType: type of file, needed as input of read_field.m
8%      .Height: image height in pixels
9%      .Width:  image width in pixels
10%      .BitDepth: nbre of bits per pixel  (8 of 16)
11%      .ColorType: 'greyscale' or 'color'
12%      .NumberOfFrames
13%      .FrameRate: nbre of frames per second, =[] for images
14% VideoObject: in case of video
15%
16% INPUT:
17% fileinput: name, including path, of the file to analyse
18
19%=======================================================================
20% Copyright 2008-2016, LEGI UMR 5519 / CNRS UGA G-INP, Grenoble, France
21%   http://www.legi.grenoble-inp.fr
22%   Joel.Sommeria - Joel.Sommeria (A) legi.cnrs.fr
23%
24%     This file is part of the toolbox UVMAT.
25%
26%     UVMAT is free software; you can redistribute it and/or modify
27%     it under the terms of the GNU General Public License as published
28%     by the Free Software Foundation; either version 2 of the license,
29%     or (at your option) any later version.
30%
31%     UVMAT is distributed in the hope that it will be useful,
32%     but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
33%     MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
34%     GNU General Public License (see LICENSE.txt) for more details.
35%=======================================================================
36
37function [FileInfo,VideoObject]=get_file_info(fileinput)
38VideoObject=[];
39if exist(fileinput,'file')==2
40    FileInfo.FileName=fileinput;
41    FileInfo.FileType='txt'; %default
42else
43    FileInfo.FileType='';
44    return
45end
46[tild,tild,FileExt]=fileparts(fileinput);%get the file extension FileExt
47
48switch FileExt
49    case '.fig'
50        FileInfo.FileType='figure';
51    case {'.xml','.xls','.dat','.bin'}
52        FileInfo.FileType=regexprep(FileExt,'^.','');% eliminate the dot of the extension;
53    case {'.seq','.sqb'}
54        [A,FileInfo,timestamps,errormsg]=read_rdvision(fileinput,[]);
55    case '.h5'
56        hinfo=hdf5info(fileinput);
57        if strcmp(hinfo.GroupHierarchy.Attributes(1).Value.Data,'MultipassPIVResults')
58            FileInfo.FileType='pivdata_fluidimage';
59            FileInfo.CivStage=6; % A MODIFIER
60        end
61    otherwise
62        if ~isempty(FileExt)% exclude empty extension
63            FileExt=regexprep(FileExt,'^.','');% eliminate the dot of the extension
64            if ~isempty(FileExt)
65                if ~isempty(imformats(FileExt))%case of images
66                    try
67                        imainfo=imfinfo(fileinput);
68                        if length(imainfo) >1 %case of image with multiple frames   
69                            FileInfo=imainfo(1);%take info from the first frame
70                            FileInfo.NumberOfFrames=length(imainfo);
71                            FileInfo.FileType='multimage';
72                        else
73                            FileInfo=imainfo;
74                            FileInfo.NumberOfFrames=1;
75                            FileInfo.FileType='image';
76                        end
77                        FileInfo.FileName=FileInfo.Filename; %correct the info given by imfinfo
78                        nbfield=numel(fieldnames(FileInfo));
79                        FileInfo=orderfields(FileInfo,[nbfield nbfield-1 nbfield-2 (1:nbfield-3)]); %reorder the fields of fileInfo for clarity
80                    end
81                else
82                    error_nc=0;
83                    try
84                       [Data,tild,tild,errormsg]=nc2struct(fileinput,[]);
85                        if ~isempty(errormsg)
86                            error_nc=1;
87                        else
88                            if isfield(Data,'absolut_time_T0') && isfield(Data,'hart') && ~isempty(Data.absolut_time_T0) && ~isempty(Data.hart)
89                                FileInfo.FileType='civx';
90                                if isfield(Data,'patch2') && isequal(Data.patch2,1)
91                                    FileInfo.CivStage=6;
92                                elseif isfield(Data,'fix2') && isequal(Data.fix2,1)
93                                    FileInfo.CivStage=5;
94                                elseif  isfield(Data,'civ2')&& isequal(Data.civ2,1)
95                                    FileInfo.CivStage=4;
96                                elseif isfield(Data,'patch')&&isequal(Data.patch,1)
97                                    FileInfo.CivStage=3;
98                                elseif isfield(Data,'fix')&&isequal(Data.fix,1)
99                                    FileInfo.CivStage=2;
100                                else
101                                    FileInfo.CivStage=1;
102                                end
103                            elseif isfield(Data,'Conventions') && strcmp(Data.Conventions,'uvmat/civdata')
104                                FileInfo.FileType='civdata'; % test for civx velocity fields
105                                FileInfo.CivStage=Data.CivStage;
106                            else
107                                FileInfo.FileType='netcdf';
108                                FileInfo.ListVarName=Data.ListVarName;
109                            end
110                        end
111                    catch ME
112                        error_nc=1;
113                    end
114                    if error_nc
115                        try
116                            if exist('VideoReader.m','file')%recent version of Matlab
117                                VideoObject=VideoReader(fileinput);
118                                FileInfo=get(VideoObject);
119                                FileInfo.FileType='video';
120                            elseif exist('mmreader.m','file')% Matlab 2009a
121                                VideoObject=mmreader(fileinput);
122                                FileInfo=get(VideoObject);
123                                FileInfo.FileType='mmreader';
124                            end
125                            FileInfo.BitDepth=FileInfo.BitsPerPixel/3;
126                            FileInfo.ColorType='truecolor';
127                            FileInfo.FileName=fileinput;
128                            nbfield=numel(fieldnames(FileInfo));
129                            FileInfo=orderfields(FileInfo,[nbfield nbfield-3 nbfield-1 nbfield-2 (1:nbfield-4)]); %reorder the fields of fileInfo for clarity
130                        end
131                    end
132                end
133            end
134        end
135end
136switch FileInfo.FileType
137    case {'image','multimage','mmreader','video','netcdf','civdata'}
138        FileInfo.FileIndexing='on'; % allow to detect file index for scanning series
139end
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.