source: trunk/src/hdf5load_recursion.m @ 985

Last change on this file since 985 was 947, checked in by sommeria, 5 years ago

read hf5 added

  • Property svn:executable set to *
File size: 2.1 KB
Line 
1% hdf5load.m
2%
3% datastruct = hdf5load_recursive(datastruct,GroupHierarchy)
4%
5% Recursive procedure used to walk the Group Hierarchy of a given hinfo
6% HDF info struct and load the data in the return struct datastruct.
7
8% Author: Gael Varoquaux <gael.varoquaux@normalesup.org>
9% Copyright: Gael Varoquaux
10% License: BSD-like
11
12% 2016-05-24: Modifications by Antoine Campagne
13
14function datastruct = hdf5load_recursive(datastruct,GroupHierarchy)
15
16% Load the datasets (the leafs of the tree):
17for i=[1:size(GroupHierarchy.Datasets,2)]
18    data=hdf5read(GroupHierarchy.Datasets(i));
19    switch class(data)
20        case 'hdf5.h5string'
21            try
22                if size(data,2)>1
23                    buffer=data ;
24                    data = {} ;
25                    for j=1:size(buffer,2)
26                        data{j}=buffer(j).Data;
27                    end
28                else
29                    data=data.Data;
30                end
31            catch
32            end
33        case 'hdf5.h5array'
34            try
35                if size(data,2)>1
36                    buffer=data ;
37                    data = {} ;
38                    for j=1:size(buffer,2)
39                        data{j}=buffer(j).Data;
40                    end
41                else
42                    data=data.Data;
43                end
44            catch
45            end
46       
47    end
48    name=GroupHierarchy.Datasets(i).Name;
49    name=strrep(name,'/','.');
50    eval(['datastruct' name '= data ;'])
51end
52for i=[1:size(GroupHierarchy.Attributes,2)]
53    data=hdf5read(GroupHierarchy.Attributes(i));
54    switch class(data)
55        case 'hdf5.h5string'
56            try
57                if size(data,2)>1
58                    buffer=data ;
59                    data = {} ;
60                    for j=1:size(buffer,2)
61                        data{j}=buffer(j).Data;
62                    end
63                else
64                    data=data.Data;
65                end
66            catch
67            end
68        case 'hdf5.h5array'
69            try
70                if size(data,2)>1
71                    buffer=data ;
72                    data = {} ;
73                    for j=1:size(buffer,2)
74                        data{j}=buffer(j).Data;
75                    end
76                else
77                    data=data.Data;
78                end
79            catch
80        end
81    end
82    name=GroupHierarchy.Attributes(i).Name;
83    name=strrep(name,'/','.');
84    eval(['datastruct' name '= data ;'])
85end
86
87% Then load the branches:
88% Create structures for the group and pass them on recursively:
89for i=[1:size(GroupHierarchy.Groups,2)]
90    name=GroupHierarchy.Groups(i).Name;
91    name=strrep(name,'/','.');
92    eval(['datastruct' name '= struct ;']);
93    datastruct = hdf5load_recursion(datastruct,GroupHierarchy.Groups(i));
94end
95
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.