Changeset 661


Ignore:
Timestamp:
Jul 5, 2013, 11:15:53 AM (7 years ago)
Author:
sommeria
Message:

option shift and displacement fixed in civ_series

Location:
trunk/src/series
Files:
2 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/src/series/civ_input.m

    r656 r661  
    8787NomTypeInput=Param.InputTable{1,4};
    8888FileExt=Param.InputTable{1,5};
    89 FileType=SeriesData.FileType{1};
     89FileType=SeriesData.FileType{1};%type of the first input file series
    9090FileInfo=SeriesData.FileInfo{1};
    9191FileInput=SeriesData.RefFile{1};
     
    118118        [PathCiv1_ImageA,Civ1_ImageA,FileExtA]=fileparts(Data.Civ1_ImageA);
    119119        [PathCiv1_ImageB,Civ1_ImageB,FileExtA]=fileparts(Data.Civ1_ImageB);
    120         %         set(handles.Civ1_ImageA,'String',Civ1_ImageA)
    121         %         set(handles.Civ1_ImageB,'String',Civ1_ImageB)
    122120        if ~isempty(Data.Civ2_ImageA)
    123121            [PathCiv2_ImageA,Civ2_ImageA,FileExtA]=fileparts(Data.Civ2_ImageA);
    124122            [PathCiv2_ImageB,Civ2_ImageB,FileExtA]=fileparts(Data.Civ2_ImageB);
    125             %         set(handles.Civ2_ImageA,'String',Civ2_ImageA)
    126             %         set(handles.Civ2_ImageB,'String',Civ2_ImageB)
    127123        end
    128124        hhseries=guidata(gcbf);
    129125        if size(Param.InputTable,1)==1
    130             series('display_file_name',hhseries,Data.Civ1_ImageA,'append');
     126            series('display_file_name',hhseries,Data.Civ1_ImageA,'append');%append the image series to the input list
    131127        end
    132128        if isfield(Data,'Txt')
     
    145141        return
    146142end
     143if numel(SeriesData.FileType)>=2 && strcmp(SeriesData.FileType{end-1},'image') &&   strcmp(SeriesData.FileType{end},'image')
     144    set(handles.ListCompareMode,'Value',3)% we compare two image series term to term ('shift')
     145    set(handles.PairIndices,'Visible','off')
     146end
    147147
    148148%% TODO: get corresponding image in nc case
     
    188188    end
    189189end
    190 %list_operation={'CheckCiv1','CheckFix1','CheckPatch1','CheckCiv2','CheckFix2','CheckPatch2'};
    191 
    192 %set(handles.(ListOptions{min(ind_opening+1,6)}),'value',1)
    193190
    194191
  • trunk/src/series/civ_series.m

    r645 r661  
    9494    else
    9595        FileType=get_file_type(filecell{1,1});
    96         iview_nc=0;
    97         iview_A=0;
    98         iview_B=0;
     96        iview_nc=0;% series index (iview) for an input nc file (for civ2 or patch2)
     97        iview_A=0;% series index (iview) for the first image series
     98        iview_B=0;% series index (iview) for the second image series (only non zero for option 'shift' )
    9999        switch FileType
    100100            case 'civdata';% =1 for images
     
    118118            displ(['ERROR: the file line ' num2str(iview_A) ' must be an image'])
    119119        end
    120         RootPath=Param.InputTable{1,1};
    121         RootFile=Param.InputTable{1,3};
    122         SubDir=Param.InputTable{1,2};
    123         NomType=Param.InputTable{1,4};
    124         FileExt=Param.InputTable{1,5};
     120        RootPath_A=Param.InputTable{1,1};
     121        RootFile_A=Param.InputTable{1,3};
     122        SubDir_A=Param.InputTable{1,2};
     123        NomType_A=Param.InputTable{1,4};
     124        FileExt_A=Param.InputTable{1,5};
    125125    end
    126126    if iview_B==0
    127127        FileType_B=FileType_A;
    128128        VideoObject_B=VideoObject_A;
    129         PairCiv1=Param.ActionInput.PairIndices.ListPairCiv1;
     129        RootPath_B=RootPath_A;
     130        RootFile_B=RootFile_A;
     131        SubDir_B=SubDir_A;
     132        NomType_B=NomType_A;
     133        FileExt_B=FileExt_A;
    130134        PairCiv2='';
    131         if isfield(Param.ActionInput.PairIndices,'ListPairCiv2')
    132             PairCiv2=Param.ActionInput.PairIndices.ListPairCiv2;
    133         end
    134         [i1_series_Civ1,i2_series_Civ1,j1_series_Civ1,j2_series_Civ1,check_bounds,NomTypeNc]=...
    135             find_pair_indices(PairCiv1,i_series{1},j_series{1},MinIndex_i,MaxIndex_i,MinIndex_j,MaxIndex_j);
    136         if ~isempty(PairCiv2)
    137             [i1_series_Civ2,i2_series_Civ2,j1_series_Civ2,j2_series_Civ2,check_bounds_Civ2]=...
    138                 find_pair_indices(PairCiv2,i_series{1},j_series{1},MinIndex_i,MaxIndex_i,MinIndex_j,MaxIndex_j);
    139             check_bounds=check_bounds | check_bounds_Civ2;
    140         end
    141         i1_series_Civ1=i1_series_Civ1(~check_bounds);
    142         i2_series_Civ1=i2_series_Civ1(~check_bounds);
    143         j1_series_Civ1=j1_series_Civ1(~check_bounds);
    144         j2_series_Civ1=j2_series_Civ1(~check_bounds);
    145         if isempty(j_series{1})
    146             FrameIndex_A_Civ1=i1_series_Civ1;
    147             FrameIndex_B_Civ1=i2_series_Civ1;
    148         else
    149             FrameIndex_A_Civ1=j1_series_Civ1;
    150             FrameIndex_B_Civ1=j2_series_Civ1;
     135        switch Param.ActionInput.ListCompareMode
     136            case 'PIV'
     137                PairCiv1=Param.ActionInput.PairIndices.ListPairCiv1;
     138                if isfield(Param.ActionInput.PairIndices,'ListPairCiv2')
     139                    PairCiv2=Param.ActionInput.PairIndices.ListPairCiv2;
     140                end
     141                [i1_series_Civ1,i2_series_Civ1,j1_series_Civ1,j2_series_Civ1,check_bounds,NomTypeNc]=...
     142                    find_pair_indices(PairCiv1,i_series{1},j_series{1},MinIndex_i,MaxIndex_i,MinIndex_j,MaxIndex_j);
     143                if ~isempty(PairCiv2)
     144                    [i1_series_Civ2,i2_series_Civ2,j1_series_Civ2,j2_series_Civ2,check_bounds_Civ2]=...
     145                        find_pair_indices(PairCiv2,i_series{1},j_series{1},MinIndex_i,MaxIndex_i,MinIndex_j,MaxIndex_j);
     146                    check_bounds=check_bounds | check_bounds_Civ2;
     147                end
     148                i1_series_Civ1=i1_series_Civ1(~check_bounds);
     149                i2_series_Civ1=i2_series_Civ1(~check_bounds);
     150                j1_series_Civ1=j1_series_Civ1(~check_bounds);
     151                j2_series_Civ1=j2_series_Civ1(~check_bounds);
     152            case 'displacement'
     153                i1_series_Civ1=Param.ActionInput.OriginIndex*ones(size(i_series{1}));
     154                i2_series_Civ1=i_series{1};i2_series_Civ2=i_series{1};
     155                j1_series_Civ1=ones(size(i_series{1}));% first j index is 1
     156                if isempty(j_series{1})
     157                    j2_series_Civ1=ones(size(i_series{1}));
     158                else
     159                    j2_series_Civ1=j_series{1};
     160                end
     161                i1_series_Civ2=i1_series_Civ1;
     162                j1_series_Civ2=j1_series_Civ1;
     163                j2_series_Civ2=j2_series_Civ1;
     164                NomTypeNc=NomType;
    151165        end
    152166        if ~isempty(PairCiv2)
     
    165179    else
    166180        [FileType_B,FileInfo,VideoObject_B]=get_file_type(filecell{2,1});
    167         if isempty(find(strcmp(FileType_B,{'multimage','mmreader','video'})))
    168             displ(['ERROR: the file line ' num2str(iview_B) ' must be an image'])
    169         end
    170         %TODO : introduce the second file series if relevant: case %displacement
     181        if ~ismember(FileType_B,{'image','multimage','mmreader','video'})
     182            displ_uvmat('ERROR',['the file line ' num2str(iview_B) ' must be an image'])
     183        end
     184        i1_series_Civ1=i_series{1};i1_series_Civ2=i_series{1};
     185        i2_series_Civ1=i_series{1};i2_series_Civ2=i_series{1};
     186        if isempty(j_series{1})
     187            j1_series_Civ1=ones(size(i_series{1}));
     188            j2_series_Civ1=ones(size(i_series{1}));
     189        else
     190            j1_series_Civ1=j_series{1};
     191            j2_series_Civ1=j_series{1};
     192        end
     193        j1_series_Civ2=j1_series_Civ1;
     194        j2_series_Civ2=j2_series_Civ1;
     195        NomTypeNc=NomType_A;
     196        RootPath_B=Param.InputTable{2,1};
     197        RootFile_B=Param.InputTable{2,3};
     198        SubDir_B=Param.InputTable{2,2};
     199        NomType_B=Param.InputTable{2,4};
     200        FileExt_B=Param.InputTable{2,5};
     201    end
     202    if isempty(j_series{1})
     203        FrameIndex_A_Civ1=i1_series_Civ1;
     204        FrameIndex_B_Civ1=i2_series_Civ1;
     205    else
     206        FrameIndex_A_Civ1=j1_series_Civ1;
     207        FrameIndex_B_Civ1=j2_series_Civ1;
    171208    end
    172209end
     
    189226
    190227%% get timing from the ImaDoc file or input video
    191 XmlFileName=find_imadoc(RootPath,SubDir,RootFile,FileExt);
     228XmlFileName=find_imadoc(RootPath_A,SubDir_A,RootFile_A,FileExt_A);
    192229time=[];
    193230if ~isempty(XmlFileName)
     
    249286            end
    250287        else
    251             ImageName_A=fullfile_uvmat(RootPath,SubDir,RootFile,FileExt,NomType,i1_series_Civ1(ifield),[],j1_series_Civ1(ifield));
     288            ImageName_A=fullfile_uvmat(RootPath_A,SubDir_A,RootFile_A,FileExt_A,NomType_A,i1_series_Civ1(ifield),[],j1_series_Civ1(ifield));
    252289            [par_civ1.ImageA,VideoObject_A] = read_image(ImageName_A,FileType_A,VideoObject_A,FrameIndex_A_Civ1(ifield));
    253             ImageName_B=fullfile_uvmat(RootPath,SubDir,RootFile,FileExt,NomType,i2_series_Civ1(ifield),[],j2_series_Civ1(ifield));
     290            ImageName_B=fullfile_uvmat(RootPath_B,SubDir_B,RootFile_B,FileExt_B,NomType_B,i2_series_Civ1(ifield),[],j2_series_Civ1(ifield));
    254291            [par_civ1.ImageB,VideoObject_B] = read_image(ImageName_B,FileType_B,VideoObject_B,FrameIndex_B_Civ1(ifield));
    255292        end
    256         ncfile=fullfile_uvmat(RootPath,OutputDir,RootFile,'.nc',NomTypeNc,i1_series_Civ1(ifield),i2_series_Civ1(ifield),...
     293        if strcmp(Param.ActionInput.ListCompareMode,'PIV')
     294        ncfile=fullfile_uvmat(RootPath_A,OutputDir,RootFile_A,'.nc',NomTypeNc,i1_series_Civ1(ifield),i2_series_Civ1(ifield),...
    257295            j1_series_Civ1(ifield),j2_series_Civ1(ifield));
     296        else
     297                   ncfile=fullfile_uvmat(RootPath_A,OutputDir,RootFile_A,'.nc',NomTypeNc,i2_series_Civ1(ifield),[],...
     298            j1_series_Civ1(ifield),j2_series_Civ1(ifield));
     299        end
    258300        par_civ1.ImageWidth=FileInfo_A.Width;
    259301        par_civ1.ImageHeight=FileInfo_A.Height;
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.