Changeset 664


Ignore:
Timestamp:
Jul 11, 2013, 11:56:47 PM (7 years ago)
Author:
sommeria
Message:

a few bugs corrected: import and retrival of parameters in series. mask in civ_series

Location:
trunk/src
Files:
5 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/src/fill_GUI.m

    r607 r664  
    77% INPUT:
    88% Param: matlab structure containing the information to display in the GUI
    9 % handles: Matlab structure containing the handles of the GUI elements
     9% GUI_handle: handle of the GUI to be filled
    1010%
    1111% see also the reverse function read_GUI.m
     
    1414%------------------------------------------------------------------------
    1515errormsg='';
    16 %handles=guidata(GUI_handle);
    17             children=get(GUI_handle,'children');
    18              handles=[];
    19             for ichild=1:numel(children)
    20                 handles.(get(children(ichild),'tag'))=children(ichild);
    21             end
     16if ~isstruct(Param)
     17    errormsg='first input parmaeter of fill_GUI must be a structure';
     18    return
     19end
     20children=get(GUI_handle,'children');
     21handles=[];
     22for ichild=1:numel(children)
     23    handles.(get(children(ichild),'tag'))=children(ichild);
     24end
    2225UserData=get(GUI_handle,'UserData');
    2326fields=fieldnames(Param);%list of fields in Param
     
    2831        if isfield(handles,fields{ifield})
    2932            set(handles.(fields{ifield}),'Visible','on')
    30             %             children=get(handles.(fields{ifield}),'children');
    31             %             for ichild=1:numel(children)
    32             %                 hchild.(get(children(ichild),'tag'))=children(ichild);
    33             %             end
    34             %   errormsg=fill_GUI(Param.(fields{ifield}),hchild);% apply the function to the substructure
    3533            errormsg=fill_GUI(Param.(fields{ifield}),handles.(fields{ifield}));% apply the function to the substructure
    36             % if the input sub-structure fits with a tag name of the GUI and a
    37             % substructure of UserData
    3834        elseif isfield(UserData,fields{ifield})&& isfield(handles,fields{ifield})&&isfield(Param.(fields{ifield}),'Name')
    3935            UserData.(fields{ifield})=Param.(fields{ifield});
     
    115111    end
    116112end
    117  
  • trunk/src/get_file_type.m

    r595 r664  
    3030        FileType='xls';
    3131    otherwise
    32         if ~isempty(FileExt) && ~isempty(imformats(regexprep(FileExt,'^.','')))
    33             try
    34                 imainfo=imfinfo(fileinput);
    35                 if length(imainfo) >1 %case of image with multiple frames
    36                     FileType='multimage';
    37                     FileInfo=imainfo(1);%take info from the first frame
    38                     FileInfo.NumberOfFrames=length(imainfo);
     32        if ~isempty(FileExt)% exclude empty extension
     33            FileExt=regexprep(FileExt,'^.','');% eliminate the dot of the extension
     34            if ~isempty(FileExt)
     35                if ~isempty(imformats(FileExt))%case of images
     36                    try
     37                        imainfo=imfinfo(fileinput);
     38                        if length(imainfo) >1 %case of image with multiple frames
     39                            FileType='multimage';
     40                            FileInfo=imainfo(1);%take info from the first frame
     41                            FileInfo.NumberOfFrames=length(imainfo);
     42                        else
     43                            FileType='image';
     44                            FileInfo=imainfo;
     45                            FileInfo.NumberOfFrames=1;
     46                        end
     47                    end
    3948                else
    40                     FileType='image';
    41                     FileInfo=imainfo;
    42                     FileInfo.NumberOfFrames=1;
    43                 end
    44             end
    45         else
    46             error_nc=0;
    47             try
    48                 Data=nc2struct(fileinput,'ListGlobalAttribute','absolut_time_T0','Conventions',...
    49                     'CivStage','patch2','fix2','civ2','patch','fix');
    50                 if isfield(Data,'Txt') && ~isempty(Data.Txt)
    51                     error_nc=1;
    52                 else
    53                     if ~isempty(Data.absolut_time_T0')
    54                         FileType='civx'; % test for civx velocity fields
    55                         if ~isempty(Data.patch2) && isequal(Data.patch2,1)
    56                             FileInfo.CivStage=6;
    57                         elseif ~isempty(Data.fix2) && isequal(Data.fix2,1)
    58                             FileInfo.CivStage=5;
    59                         elseif ~isempty(Data.civ2) && isequal(Data.civ2,1);
    60                             FileInfo.CivStage=4;
    61                         elseif ~isempty(Data.patch) && isequal(Data.patch,1);
    62                             FileInfo.CivStage=3;
    63                         elseif ~isempty(Data.fix) && isequal(Data.fix,1);
    64                             FileInfo.CivStage=2;
    65                         elseif ~isempty(Data.absolut_time_T0) && ~isempty(Data.hart)
    66                             FileInfo.CivStage=1;
     49                    error_nc=0;
     50                    try
     51                        Data=nc2struct(fileinput,'ListGlobalAttribute','absolut_time_T0','Conventions',...
     52                            'CivStage','patch2','fix2','civ2','patch','fix');
     53                        if isfield(Data,'Txt') && ~isempty(Data.Txt)
     54                            error_nc=1;
     55                        else
     56                            if ~isempty(Data.absolut_time_T0')
     57                                FileType='civx'; % test for civx velocity fields
     58                                if ~isempty(Data.patch2) && isequal(Data.patch2,1)
     59                                    FileInfo.CivStage=6;
     60                                elseif ~isempty(Data.fix2) && isequal(Data.fix2,1)
     61                                    FileInfo.CivStage=5;
     62                                elseif ~isempty(Data.civ2) && isequal(Data.civ2,1);
     63                                    FileInfo.CivStage=4;
     64                                elseif ~isempty(Data.patch) && isequal(Data.patch,1);
     65                                    FileInfo.CivStage=3;
     66                                elseif ~isempty(Data.fix) && isequal(Data.fix,1);
     67                                    FileInfo.CivStage=2;
     68                                elseif ~isempty(Data.absolut_time_T0) && ~isempty(Data.hart)
     69                                    FileInfo.CivStage=1;
     70                                end
     71                            elseif strcmp(Data.Conventions,'uvmat/civdata')
     72                                FileType='civdata'; % test for civx velocity fields
     73                                FileInfo.CivStage=Data.CivStage;
     74                            else
     75                                FileType='netcdf';
     76                            end
    6777                        end
    68                     elseif strcmp(Data.Conventions,'uvmat/civdata')
    69                         FileType='civdata'; % test for civx velocity fields
    70                         FileInfo.CivStage=Data.CivStage;
    71                     else
    72                         FileType='netcdf';
     78                    catch ME
     79                        error_nc=1;
    7380                    end
    74                 end
    75             catch ME
    76                 error_nc=1;
    77             end
    78             if error_nc
    79                 try
    80                     if exist('VideoReader.m','file')%recent version of Matlab
    81                         VideoObject=VideoReader(fileinput);
    82                         FileInfo=get(VideoObject);
    83                         FileType='video';
    84                     elseif exist('mmreader.m','file')% Matlab 2009a
    85                         VideoObject=mmreader(fileinput);
    86                         FileInfo=get(VideoObject);
    87                         FileType='mmreader';
    88                     end 
    89                     FileInfo.BitDepth=FileInfo.BitsPerPixel/3;
     81                    if error_nc
     82                        try
     83                            if exist('VideoReader.m','file')%recent version of Matlab
     84                                VideoObject=VideoReader(fileinput);
     85                                FileInfo=get(VideoObject);
     86                                FileType='video';
     87                            elseif exist('mmreader.m','file')% Matlab 2009a
     88                                VideoObject=mmreader(fileinput);
     89                                FileInfo=get(VideoObject);
     90                                FileType='mmreader';
     91                            end
     92                            FileInfo.BitDepth=FileInfo.BitsPerPixel/3;
     93                        end
     94                    end
    9095                end
    9196            end
  • trunk/src/mouse_motion.m

    r663 r664  
    5757    test_edit_object=get(hhuvmat.CheckEditObject,'Value');
    5858    test_ruler=isequal(get(hhuvmat.MenuRuler,'checked'),'on');
    59     test_transform=~isequal(get(hhuvmat.TransformName,'Value'),1)
     59    test_transform=~isequal(get(hhuvmat.TransformName,'Value'),1);
    6060end
    6161test_piv=0;
  • trunk/src/series.m

    r654 r664  
    25632563
    25642564InputTable=get(handles.InputTable,'Data');
    2565 [FileName, PathName] = uigetfile( ...
    2566        {'*.xml', ' (*.xml)';
    2567        '*.xml',  '.xml files '; ...
    2568         '*.*',  'All Files (*.*)'}, ...
    2569         'Pick a file',InputTable{1,1});
    2570 filexml=[PathName FileName];%complete file name
    2571 if isempty(filexml),return;end %abandon if no file is introduced by the browser
    2572 Param=xml2struct(filexml);
    2573 fill_GUI(Param,handles.series)
     2565filexml=uigetfile_uvmat('pick a xml parameter file',InputTable{1,1},'.xml');
     2566% [FileName, PathName] = uigetfile( ...
     2567%        {'*.xml', ' (*.xml)';
     2568%        '*.xml',  '.xml files '; ...
     2569%         '*.*',  'All Files (*.*)'}, ...
     2570%         'Pick a file',InputTable{1,1});
     2571% filexml=[PathName FileName];%complete file name
     2572if ~isempty(filexml)%abandon if no file is introduced by the browser
     2573    Param=xml2struct(filexml);
     2574    fill_GUI(Param,handles.series)
     2575    if isfield(Param,'ActionInput')
     2576            set(handles.ActionInput,'Visible','on')
     2577    set(handles.ActionInput_title,'Visible','on')
     2578    set(handles.ActionInputView,'Visible','on')
     2579    set(handles.ActionInputView,'Value',0)
     2580    %set(handles.ActionInput,'String',ActionName)
     2581%    ParamOut.ActionInput.Program=ActionName; % record the program in ActionInput
     2582    SeriesData=get(handles.series,'UserData');
     2583    SeriesData.ActionInput=Param.ActionInput;
     2584    set(handles.series,'UserData',SeriesData)
     2585    end
     2586    ActionName_Callback([],[],handles)
     2587end
    25742588
    25752589%------------------------------------------------------------------------
  • trunk/src/uigetfile_uvmat.m

    r653 r664  
    123123function OK_Callback(option,filter_ext,hObject,event)
    124124hfig=get(hObject,'parent');%handle of the fig
    125 % if ~strcmp(get(hfig,'SelectionType'),'open')
    126 %     return %select double click
    127 % end
    128 %set(hObject,'BackgroundColor',[1 1 0])% paint list in yellow to indicate action
    129 %     drawnow
    130125htitlebox=findobj(hfig,'tag','titlebox');  % display the current dir name 
    131126DirName=get(htitlebox,'String');
     
    135130    list=get(hlist,'String');
    136131    index=get(hlist,'Value');
    137     SelectName=regexprep(list{index},'^\+/','');% remove the +/ used to mark dir
     132    if ~isempty(regexp(list{index},'^\+/'))
     133        return % quit if a dir has been opened
     134    end
     135    %SelectName=regexprep(list{index},'^\+/','');% remove the +/ used to mark dir
     136    SelectName=list{index};
    138137    ind_dot=regexp(SelectName,'\s*\.\.\.');%remove what is beyond  '...'
    139138    if ~isempty(ind_dot)
    140139        SelectName=SelectName(1:ind_dot-1);
    141140    end
    142     % if strcmp(SelectName,'..')% the upward dir option has been selected
    143     %     FullSelectName=fileparts(DirName);
    144     % else
    145141    FullSelectName=fullfile(DirName,SelectName);
    146     % end
    147142    if exist(FullSelectName,'file')
    148143        switch option
     
    164159    end
    165160end
    166 %set(hObject,'BackgroundColor',[0.7 0.7 0.7])% paint list in grey to indicate action end
    167161
    168162uiresume(get(hObject,'parent'))
     
    253247%------------------------------------------------------------------------
    254248hfig=get(hObject,'parent');%handle of the fig
    255 % if ~strcmp(get(hfig,'SelectionType'),'open')
    256 %     return %select double click
    257 % end
    258249set(hObject,'BackgroundColor',[1 1 0])% paint list in yellow to indicate action
    259250    drawnow
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.