Changeset 90


Ignore:
Timestamp:
May 21, 2010, 5:01:40 PM (11 years ago)
Author:
gostiaux
Message:
 
File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/src/civ.m

    r89 r90  
    23292329        if isunix % check: necessaire aussi en RUN?
    23302330           %fid=fopen([filename '.cmx'],'w')
    2331            cmd='#!/bin/bash';
    2332            cmd=[cmd '\n' '#$ -cwd'];
    2333            cmd=[cmd '\n' 'hostname && date'];
     2331           cmd='#!/bin/bash \n';
     2332           cmd=[cmd '#$ -cwd \n'];
     2333           cmd=[cmd 'hostname && date \n'];
    23342334        end
    23352335        if civAll
     
    23992399            i_cmd=i_cmd+1;
    24002400            if isequal(civAll,0)
    2401                 cmd=[cmd '\n' BATCH_CIV1(filename_cmx(1:end-4),namelog,par_civ1,handles,sparam)];
     2401                cmd=[cmd BATCH_CIV1(filename_cmx(1:end-4),namelog,par_civ1,handles,sparam) '\n'];
    24022402            else
    24032403                 civAllCmd=[civAllCmd ' civ1 '];
     
    24312431                   ' -fi2 ' num2str(flagindex1(2)) ' -fi3 ' num2str(flagindex1(3)) ...
    24322432                   ' -threshC ' num2str(thresh_vecC1) ' -threshV ' num2str(thresh_vel1) ' -maskName ' maskname];
    2433            cmd=[cmd '\n' cmd_FIX];
     2433           cmd=[cmd cmd_FIX '\n'];
    24342434           else
    24352435                fix1.inputFileName=filecell.nc.civ1{ifile,j} ;
     
    24562456        if isequal(civAll,0)
    24572457            cmd_PATCH=RUN_PATCH(filecell.nc.civ1{ifile,j},nx_patch1,ny_patch1,rho_patch1,subdomain_patch1,thresh_patch1,test_interp,PatchBin);
    2458             cmd=[cmd '\n' cmd_PATCH];
     2458            cmd=[cmd cmd_PATCH '\n'];
    24592459        else
    24602460            patch1.inputFileName=filecell.nc.civ1{ifile,j} ;
     
    25682568            if isequal(civAll,0)
    25692569                if(isunix)
    2570                     cmd=[cmd '\n' 'cp -f ' filename_cmx '2 ' filename_cmx '\n' cmd_CIV2];
     2570                    cmd=[cmd 'cp -f ' filename_cmx '2 ' filename_cmx '\n' cmd_CIV2 '\n'];
    25712571                else
    2572                     cmd=[cmd '\n' 'copy /Y ' filename_cmx '2 ' filename_cmx '\n' cmd_CIV2];
     2572                    cmd=[cmd 'copy /Y ' filename_cmx '2 ' filename_cmx '\n' cmd_CIV2 '\n'];
    25732573                end
    25742574            else
     
    26032603                   ' -fi2 ' num2str(flagindex2(2)) ' -fi3 ' num2str(flagindex2(3)) ...
    26042604                   ' -threshC ' num2str(thresh_vec2C) ' -threshV ' num2str(thresh_vel2) ' -maskName ' maskname];
    2605                 cmd=[cmd '\n' cmd_FIX];
     2605                cmd=[cmd cmd_FIX '\n'];
    26062606           else                     
    26072607                fix2.inputFileName=filecell.nc.civ2{ifile,j} ;
     
    26282628            if isequal(civAll,0)
    26292629                cmd_PATCH=RUN_PATCH(filecell.nc.civ2{ifile,j},nx_patch2,ny_patch2,rho_patch2,subdomain_patch2,thresh_patch2,test_interp,PatchBin);
    2630                 cmd=[cmd '\n' cmd_PATCH];
     2630                cmd=[cmd cmd_PATCH '\n'];
    26312631            else
    26322632                patch2.inputFileName=filecell.nc.civ1{ifile,j} ;
     
    26742674            save(civAllxml,[filename_cmx([1:end-4]) '.xml']);
    26752675            %cmd=char({cmd;[CivBin ' -f ' [filename_cmx([1:end-4]) '.xml'] ' ' civAllCmd]});
    2676             cmd=[cmd '\n' CivBin ' -f ' filename_cmx(1:end-4) '.xml '  civAllCmd];
     2676            cmd=[cmd CivBin ' -f ' filename_cmx(1:end-4) '.xml '  civAllCmd  '\n'];
    26772677        end
    26782678      % create the .bat file:
     
    26852685        filename_bat(end-2:end)='bat';
    26862686        fid=fopen(filename_bat,'w');
    2687          
    26882687        fprintf(fid,cmd);
    26892688        fclose(fid);
     
    48274826%
    48284827%             textout=char(textcmx);
    4829 
     4828par.filename_ima_a=regexprep(par.filename_ima_a,'.png','');
     4829par.filename_ima_b=regexprep(par.filename_ima_b,'.png','');
    48304830   fid=fopen([filename '.cmx'],'w');
    48314831fprintf(fid,['##############   CMX file' '\n' ]);
    4832  fprintf(fid,   ['FirstImage ' par.filename_ima_a '\n' ]);
    4833  fprintf(fid,   ['LastImage  ' par.filename_ima_b '\n' ]);
     4832 fprintf(fid,   ['FirstImage ' regexprep(par.filename_ima_a,'\\','\\\\') '\n' ]);
     4833 fprintf(fid,   ['LastImage  ' regexprep(par.filename_ima_b,'\\','\\\\') '\n' ]);
    48344834  fprintf(fid,  ['XX' '\n' ]);
    48354835  fprintf(fid,  ['Mask ' par.maskflag '\n' ]);
     
    48624862 
    48634863cmd_CIV1=[sparam.Civ1Bin ' -f ' filename '.cmx' ]; % redirect standard output to the log file
     4864cmd_CIV1=regexprep(cmd_CIV1,'\\','\\\\');
     4865namelog=regexprep(namelog,'\\','\\\\');
     4866
    48644867if(isunix)
    48654868    [Rootbat,Filebat,extbat]=fileparts(namelog);
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.