Changeset 1057 for trunk


Ignore:
Timestamp:
Aug 29, 2018, 12:39:05 PM (2 years ago)
Author:
sommeria
Message:

reading color images repaired

Location:
trunk/src
Files:
5 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/src/find_field_bounds.m

    r1028 r1057  
    3838    return
    3939end
    40 
    4140NbDim=max(NbDimArray);% spatial dimension of the input field
    4241imax=find(NbDimArray==NbDim);% indices of field cells to consider
  • trunk/src/find_field_cells.m

    r1049 r1057  
    306306        CellInfo{icell}.DimOrder=[];
    307307        if NbDim(icell)==3
    308             %coord z
    309             for ivar=ind_coord_z
    310                 if check_coord_names(ivar)
    311                     DimRank=find(strcmp(Data.VarDimName{ivar},DimCell_var));
     308            if strcmp(DimCell_var{3},'rgb')
     309                NbDim(icell)=2;% case of color images
     310            else
     311                %coord z
     312                for ivar=ind_coord_z
     313                    if check_coord_names(ivar)
     314                        DimRank=find(strcmp(Data.VarDimName{ivar},DimCell_var));
     315                        check_coord=~isempty(DimRank);
     316                    elseif check_coord_raster(ivar)
     317                        DimRank=find(strcmp(Data.ListVarName{ivar},DimCell_var));
     318                        check_coord=~isempty(DimRank);
     319                    end
     320                    %                 check_coord= (check_coord_names(ivar) && strcmp(Data.VarDimName{ivar},DimCell_var{1}))||...% coord varbable
     321                    %                     (check_coord_raster(ivar) && strcmp(Data.ListVarName{ivar},DimCell_var{1})); % rasrewr coord defined by min and max
     322                    if check_coord
     323                        CellInfo{icell}.CoordType='grid';
     324                        CellInfo{icell}.CoordIndex(1)=ivar;
     325                        CellInfo{icell}.ZName=Data.ListVarName{ivar};
     326                        CellInfo{icell}.ZIndex=ivar;
     327                        CellInfo{icell}.DimOrder=DimRank;
     328                        break
     329                    end
     330                end
     331            end
     332        end
     333        for ivar=ind_coord_y
     334            if check_coord_names(ivar)
     335                DimRank=find(strcmp(Data.VarDimName{ivar},DimCell_var));
    312336                check_coord=~isempty(DimRank);
    313337            elseif check_coord_raster(ivar)
     
    315339                check_coord=~isempty(DimRank);
    316340            end
    317 %                 check_coord= (check_coord_names(ivar) && strcmp(Data.VarDimName{ivar},DimCell_var{1}))||...% coord varbable
    318 %                     (check_coord_raster(ivar) && strcmp(Data.ListVarName{ivar},DimCell_var{1})); % rasrewr coord defined by min and max
    319                 if check_coord
    320                     CellInfo{icell}.CoordType='grid';
    321                     CellInfo{icell}.CoordIndex(1)=ivar;
    322                     CellInfo{icell}.ZName=Data.ListVarName{ivar};
    323                     CellInfo{icell}.ZIndex=ivar;
    324                     CellInfo{icell}.DimOrder=DimRank;
    325                     break
    326                 end
    327             end
    328         end
    329         for ivar=ind_coord_y
    330             if check_coord_names(ivar)
    331                     DimRank=find(strcmp(Data.VarDimName{ivar},DimCell_var));
    332                 check_coord=~isempty(DimRank);
    333             elseif check_coord_raster(ivar)
    334                 DimRank=find(strcmp(Data.ListVarName{ivar},DimCell_var));
    335                 check_coord=~isempty(DimRank);
    336             end
    337 %             check_coord= (check_coord_names(ivar) && strcmp(Data.VarDimName{ivar},DimCell_var{NbDim(icell)-1}))||...% coord variable
    338 %                 (check_coord_raster(ivar) && strcmp(Data.ListVarName{ivar},DimCell_var{NbDim(icell)-1})); % rasrewr coord defined by min and max
     341            %             check_coord= (check_coord_names(ivar) && strcmp(Data.VarDimName{ivar},DimCell_var{NbDim(icell)-1}))||...% coord variable
     342            %                 (check_coord_raster(ivar) && strcmp(Data.ListVarName{ivar},DimCell_var{NbDim(icell)-1})); % rasrewr coord defined by min and max
    339343            if check_coord
    340344                CellInfo{icell}.CoordType='grid';
     
    348352        for ivar=ind_coord_x
    349353            if check_coord_names(ivar)
    350                     DimRank=find(strcmp(Data.VarDimName{ivar},DimCell_var));
     354                DimRank=find(strcmp(Data.VarDimName{ivar},DimCell_var));
    351355                check_coord=~isempty(DimRank);
    352356            elseif check_coord_raster(ivar)
     
    354358                check_coord=~isempty(DimRank);
    355359            end
    356 %             check_coord= (check_coord_names(ivar) && strcmp(Data.VarDimName{ivar},DimCell_var{NbDim(icell)}))||...% coord variable
    357 %                 (check_coord_raster(ivar) && strcmp(Data.ListVarName{ivar},DimCell_var{NbDim(icell)})); % raster coord defined by min and max
     360            %             check_coord= (check_coord_names(ivar) && strcmp(Data.VarDimName{ivar},DimCell_var{NbDim(icell)}))||...% coord variable
     361            %                 (check_coord_raster(ivar) && strcmp(Data.ListVarName{ivar},DimCell_var{NbDim(icell)})); % raster coord defined by min and max
    358362            if check_coord
    359363                CellInfo{icell}.CoordIndex(NbDim(icell))=ivar;
     
    400404                    CellInfo{icell}.CoordSize=[size(Data.(VarName),3) size(Data.(VarName),2) size(Data.(VarName),1)];
    401405                else
    402                     CellInfo{icell}.CoordSize=[size(Data.(VarName),2) size(Data.(VarName),1)];
     406                    CellInfo{icell}.CoordSize=[size(Data.(VarName),1) size(Data.(VarName),2)];
    403407                end
    404408            case 'tps'
  • trunk/src/proj_field.m

    r1054 r1057  
    16081608                    XI=ObjectData.Coord(1,1)+(X)*cos(PlaneAngle(2))-YI*sin(PlaneAngle(1));%corresponding coordinates in the original system
    16091609                    YI=ObjectData.Coord(1,2)+(X)*sin(PlaneAngle(2))+YI*cos(PlaneAngle(1));
    1610                     if numel(Coord{1})==2% x coordiante defiend by its bounds, get the whole set
     1610
     1611                    if numel(Coord{1})==2% x coordinate defined by its bounds, get the whole set
    16111612                        Coord{1}=linspace(Coord{1}(1),Coord{1}(2),CellInfo{icell}.CoordSize(1));
    16121613                    end
  • trunk/src/transform_field/ima_color2BW.m

    r1027 r1057  
    2626%=======================================================================
    2727
    28 function DataOut=ima_color2BW(DataIn)
    29 
     28function DataOut=ima_color2BW(DataIn,XmlData)
     29DataOut=[];
     30if isfield(DataIn,'Action') && isfield(DataIn.Action,'RUN') && isequal(DataIn.Action.RUN,0)
     31    return
     32end
    3033DataOut=DataIn; %default
    3134if ndims(DataOut.A)==3
  • trunk/src/uvmat.m

    r1054 r1057  
    36153615            ParamIn_1.Coord_y=get(handles.Coord_y,'String');
    36163616        end
    3617         [Field{2},ParamOut_1,errormsg] = read_field(FileName_1,UvData.FileType{2},ParamIn_1,frame_index_1);
     3617        [Field{2},ParamOut_1,errormsg] = read_field(FileName_1,UvData.FileInfo{2}.FileType,ParamIn_1,frame_index_1);
    36183618        if ~isempty(errormsg)
    36193619            errormsg=['error in reading ' FieldName_1 ' in ' FileName_1 ': ' errormsg];
    36203620            return
    36213621        end
    3622         if isstruct(ParamOut_1)&&~strcmp(ParamOut_1.FieldName,'get_field...')&& (strcmp(UvData.FileType{2},'civdata')||strcmp(UvData.FileType{2},'civx'))...
     3622        if isstruct(ParamOut_1)&&~strcmp(ParamOut_1.FieldName,'get_field...')&& (strcmp(UvData.FileInfo{2}.FileType,'civdata')||strcmp(UvData.FileInfo{2}.FileType,'civx'))...
    36233623                &&~strcmp(ParamOut_1.FieldName,'velocity') && ~strcmp(ParamOut_1.FieldName,'get_field...')
    36243624            if ~check_proj_tps
     
    36683668        test_veltype_1=1;
    36693669        set(handles.VelType_1,'Visible','on')
    3670         menu=set_veltype_display(ParamOut_1.CivStage,UvData.FileType{2});
     3670        menu=set_veltype_display(ParamOut_1.CivStage,UvData.FileInfo{2}.FileType);
    36713671        index_menu=strcmp(ParamOut_1.VelType,menu);
    36723672        set(handles.VelType_1,'Value',1+find(index_menu,1))
     
    41194119    % display menus and plot histograms
    41204120    test_v=0;
    4121     %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% A REMETTRE
    41224121    if ~isempty(menu_histo)
    41234122        set(handles.HistoMenu,'Value',1)
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.