Changeset 491


Ignore:
Timestamp:
Jul 11, 2012, 2:56:40 PM (12 years ago)
Author:
sommeria
Message:

fix the the way to deal with filter fields using tps
fix the main projection plane in uvmat

Location:
trunk/src
Files:
5 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • trunk/src/calc_field.m

    r412 r491  
    6767for ilist=1:length(FieldList)
    6868    switch FieldList{ilist}
    69         case {'u','v'}
     69        case {'u','v','velocity','norm_vel','ima_cor'}
    7070            check_grid=1;% needs a regular grid
    7171        case{'vort','div','strain'}% needs spatial derivatives spatial derivatives
    7272            check_der=1;
    73         case {'velocity','norm_vel','ima_cor'};
     73%         case {'velocity','norm_vel','ima_cor'};
    7474        otherwise
    7575            check_calc(ilist)=0;
    … …  
    119119        coord_x=XMin:DataIn.Mesh:XMax;
    120120        coord_y=YMin:DataIn.Mesh:YMax;
    121         npx=length(coord_x);
    122         npy=length(coord_y);
     121%         npx=length(coord_x);
     122%         npy=length(coord_y);
    123123        DataOut.coord_x=[XMin XMax];
    124124        DataOut.coord_y=[YMin YMax];
    125125        [XI,YI]=meshgrid(coord_x,coord_y);
    126         XI=reshape(XI,[],1);
    127         YI=reshape(YI,[],1);
    128         Coord_interp=[XI YI];
    129     end
    130    
     126%         XI=reshape(XI,[],1);
     127%         YI=reshape(YI,[],1);
     128        Coord_interp=cat(3,XI,YI);%[XI YI];
     129    end
     130    npx=size(Coord_interp,2);
     131    npy=size(Coord_interp,1);
     132    Coord_interp=reshape(Coord_interp,npx*npy,size(Coord_interp,3));
     133%         npy=length(coord_y);
    131134    %initialise output
    132135    nb_sites=size(Coord_interp,1);

  • trunk/src/find_field_indices.m

    r477 r491  
    22%    group the variables  into 'fields' with common dimensions
    33%------------------------------------------------------------------------
    4 % function  [CellVarIndex,NbDim,VarType,errormsg]=find_field_indices(Data)
     4% function  [CellVarIndex,NbDim,CellVarType,errormsg]=find_field_indices(Data)
    55%
    66% OUTPUT:
    … …  
    88%              CellvarIndex{i} represents a set of variables with the same dimensions
    99% NbDim: array with the length of CellVarIndex, giving its  space dimension
    10 % VarType: cell array of structures with fields
     10% CellVarType: cell array of structures with fields
    1111%      .coord_x, y, z: indices (in .ListVarname) of variables representing  unstructured coordinates x, y, z
    1212%      .vector_x,_y,_z: indices of variables giving the vector components x, y, z
    … …  
    4747%     but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
    4848%     MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
     49%     GNU General Public License (file UVMAT/COPYING.txt) for more details.for input in proj_field and plot_field
     50%    group the variables  into 'fields' with common dimensions
     51%------------------------------------------------------------------------
     52% function  [CellVarIndex,NbDim,CellVarType,errormsg]=find_field_indices(Data)
     53%
     54% OUTPUT:
     55% CellVaxIndex: cell whose elements are arrays of indices in the list data.ListVarName 
     56%              CellvarIndex{i} represents a set of variables with the same dimensions
     57% NbDim: array with the length of CellVarIndex, giving its  space dimension
     58% CellVarType: cell array of structures with fields
     59%      .coord_x, y, z: indices (in .ListVarname) of variables representing  unstructured coordinates x, y, z
     60%      .vector_x,_y,_z: indices of variables giving the vector components x, y, z
     61%      .warnflag: index of warnflag
     62%      .errorflag: index of error flag
     63%      .ancillary: indices of ancillary variables
     64%      .image   : B/W image, (behaves like scalar)
     65%      .color : color image, the last index, which is not a coordinate variable, represent the 3 color components rgb
     66%      .discrete: like scalar, but set of data points without continuity, represented as dots in a usual plot, instead of continuous lines otherwise
     67%      .scalar: scalar field (default)
     68%      .coord: vector of indices of coordinate variables corresponding to matrix dimensions
     69% errormsg: error message
     70%   
     71% INPUT:
     72% Data: structure representing fields, output of check_field_structure
     73%            .ListVarName: cell array listing the names (cahr strings) of the variables
     74%            .VarDimName: cell array of cells containing the set of dimension names for each variable of .ListVarName
     75%            .VarAttribute: cell array of structures containing the variable attributes:
     76%                     .VarAttribute{ilist}.key=value, where ilist is the variable
     77%                     index, key is the name of the attribute, value its value (char string or number)
     78%
     79% HELP:
     80% to get the dimensions of arrays common to the field #icell
     81%         VarIndex=CellVarIndex{icell}; % list of variable indices
     82%         DimIndex=Data.VarDimIndex{VarIndex(1)} % list of dimensions for each variable in the cell #icell
     83%
     84%AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
     85%  Copyright Joel Sommeria, 2008, LEGI / CNRS-UJF-INPG, sommeria@coriolis-legi.org.
     86%AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
     87%     This file is part of the toolbox UVMAT.
     88%
     89%     UVMAT is free software; you can redistribute it and/or modify
     90%     it under the terms of the GNU General Public License as published by
     91%     the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or
     92%     (at your option) any later version.
     93%
     94%     UVMAT is distributed in the hope that it will be useful,
     95%     but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
     96%     MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
    4997%     GNU General Public License (file UVMAT/COPYING.txt) for more details.
    5098%AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
    5199
    52 function [CellVarIndex,NbDim,VarType,errormsg]=find_field_indices(Data)
     100function [CellVarIndex,NbDim,CellVarType,errormsg]=find_field_indices(Data)
    53101CellVarIndex={};
    54102
    55103NbDim=[];
    56 VarType=[];
     104CellVarType=[];
    57105errormsg=[];
    58106nbvar=numel(Data.ListVarName);%number of field variables
    59107icell=0;
     108
     109NbDim=[];
    60110ivardim=0;
    61111VarDimIndex=[];
    … …  
    64114    errormsg='missing .VarDimName';
    65115    return
     116end
     117
     118%% role of variables
     119Role=mat2cell(blanks(nbvar),1,ones(1,nbvar));%initialize a cell array of nbvar blanks
     120Role=regexprep(Role,' ','scalar'); % Role set to 'scalar' by default
     121if isfield(Data,'VarAttribute')
     122    for ivar=1:numel(Data.VarAttribute)
     123        if isfield(Data.VarAttribute{ivar},'Role')
     124            Role{ivar}=Data.VarAttribute{ivar}.Role;
     125        end
     126    end
    66127end
    67128
    … …  
    90151    %look for dimension variables
    91152    if numel(DimCell)==1% if the variable has a single dimension
    92         Role='';
    93         if isfield(Data,'VarAttribute') && length(Data.VarAttribute)>=ivar && isfield(Data.VarAttribute{ivar},'Role')
    94             Role=Data.VarAttribute{ivar}.Role;
    95         end
    96         if strcmp(DimCell{1},Data.ListVarName{ivar}) || strcmp(Role,'dimvar')
     153        if strcmp(DimCell{1},Data.ListVarName{ivar}) || strcmp(Role{ivar},'dimvar')
    97154            ivardim=ivardim+1;
    98155            VarDimIndex(ivardim)=ivar;%index of the variable
    … …  
    103160
    104161%% find the spatial dimensions and vector components
    105 ListRole={'coord_x','coord_y','coord_z','vector_x','vector_y','vector_z','warnflag','errorflag',...
    106     'ancillary','image','color','discrete','scalar','coord_tps'};
     162ListRole={'coord_x','coord_y','coord_z','vector_x','vector_y','vector_z','vector_x_tps','vector_y_tps','warnflag','errorflag',...
     163    'ancillary','image','color','discrete','scalar','coord_tps'};% rmq vector_x_tps and vector_y_tps to be replaced by vector_x and vector_y
    107164NbDim=zeros(size(CellVarIndex));%default
    108 if isfield(Data,'VarAttribute');
    109     VarAttribute=Data.VarAttribute;
    110 else
    111     VarAttribute={};
    112 end
     165
     166for ilist=1:numel(ListRole)
     167    VarType.(ListRole{ilist})=find(strcmp(ListRole{ilist},Role));
     168end
     169%look for tps coordinates
     170if ~isempty(VarType.coord_tps)
     171    VarType.subrange_tps=[];
     172    VarType.nbsites_tps=[];
     173    for ifield=1:numel(VarType.coord_tps)
     174        select(ifield)=0;
     175        DimCell=Data.VarDimName{VarType.coord_tps(ifield)};
     176        if numel(DimCell)==3
     177            for ivardim=1:numel(Data.VarDimName)
     178                if strcmp(Data.VarDimName{ivardim},DimCell{3})
     179                    VarType.nbsites_tps=[VarType.nbsites_tps ivardim];
     180                    select(ifield)=select(ifield)+1;
     181                elseif strcmp(Data.VarDimName{ivardim}{1},DimCell{2}) && strcmp(Data.VarDimName{ivardim}{3},DimCell{3})
     182                    VarType.subrange_tps=[VarType.subrange_tps ivardim];
     183                    select(ifield)=select(ifield)+1;
     184                end
     185            end
     186        end
     187    end
     188    VarType.coord_tps=VarType.coord_tps(select==2);
     189    VarType.subrange_tps=VarType.subrange_tps(select==2);
     190    VarType.nbsites_tps=VarType.nbsites_tps(select==2);
     191end
     192
     193index_remove=[];
     194CellVarType=cell(1,length(CellVarIndex));
    113195for icell=1:length(CellVarIndex)
    114     for ilist=1:numel(ListRole)
    115         eval(['ivar_' ListRole{ilist} '=[];'])
    116     end
    117     VarIndex=CellVarIndex{icell};%set of variable indices with the same dim
    118     DimCell=Data.VarDimName{VarIndex(1)};% list of dimensions for each variable in the cell #icell
    119     test_2D=0;
    120     for ivar=VarIndex
    121         if length(VarAttribute)>=ivar
    122             if isfield(VarAttribute{ivar},'Role')
    123                 role=VarAttribute{ivar}.Role;
    124                 switch role
    125                     case ListRole
    126                         eval(['ivar_' role '=[ivar_' role ' ivar];'])
    127                     otherwise
    128                        ivar_scalar=[ivar_scalar ivar];%variables are consiered as 'scalar' by default (in the absence of attribute 'Role')
     196    VarIndex=CellVarIndex{icell};%set of variable indices with the same dim
     197    check_remove=0;
     198    for ifield=1:numel(VarType.coord_tps)
     199        if isequal(VarIndex,VarType.coord_tps(ifield))||isequal(VarIndex,VarType.subrange_tps(ifield))||isequal(VarIndex,VarType.nbsites_tps(ifield))
     200            index_remove=[index_remove icell];% removes Coord_tps as field cell
     201            check_remove=1;
     202        end
     203    end
     204   
     205    if ~check_remove
     206        for ilist=1:numel(ListRole)
     207            CellVarType{icell}.(ListRole{ilist})=VarIndex(find(strcmp(ListRole{ilist},Role(VarIndex))));
     208        end
     209        DimCell=Data.VarDimName{VarIndex(1)};% list of dimensions for each variable in the cell #icell
     210        if numel(CellVarType{icell}.coord_x)>1 || numel(CellVarType{icell}.coord_y)>1 || numel(CellVarType{icell}.coord_z)>1
     211            errormsg='multiply defined coordinates  in the same cell';
     212            return
     213        end
     214        if numel(CellVarType{icell}.errorflag)>1
     215            errormsg='multiply defined error flag in the same cell';
     216            return
     217        end
     218        if numel(CellVarType{icell}.warnflag)>1
     219            errormsg='multiply defined warning flag in the same cell';
     220            return
     221        end
     222        test_coord=0;
     223        % look for unstructured coordinates
     224        if numel(VarIndex)>1
     225            if ~isempty(CellVarType{icell}.coord_z)
     226                NbDim(icell)=3;
     227                test_coord=1;
     228            elseif ~isempty(CellVarType{icell}.coord_y)
     229                NbDim(icell)=2;
     230                test_coord=1;
     231            elseif ~isempty(CellVarType{icell}.coord_x)
     232                NbDim(icell)=1;
     233                test_coord=1;
     234            end
     235        end
     236        % look for coordinates variables
     237        coord=zeros(1,numel(DimCell));%default
     238        %     if NbDim(icell)==0 && ~isempty(VarDimName)% no unstructured coordinate found
     239        if  ~test_coord && ~isempty(VarDimName)
     240            for idim=1:numel(DimCell)   %loop on the dimensions of the variables in cell #icell
     241                for ivardim=1:numel(VarDimName)
     242                    if strcmp(VarDimName{ivardim},DimCell{idim})
     243                        coord(idim)=VarDimIndex(ivardim);
     244                        break
     245                    end
    129246                end
    130             else
    131               ivar_scalar=[ivar_scalar ivar];% variable considered as scalar in the absence of Role attribute 
    132             end
    133             if isfield(VarAttribute{ivar},'Coord_2')
    134                 test_2D=1; %obsolete convention
    135             end
    136         else
    137             ivar_scalar=[ivar_scalar ivar];%variables are consiered as 'scalar' by default (in the absence of attribute 'Role')
    138         end
    139     end
    140     for ilist=1:numel(ListRole)
    141         eval(['VarType{icell}.' ListRole{ilist} '=ivar_' ListRole{ilist} ';'])
    142     end
    143     if numel(ivar_coord_x)>1 || numel(ivar_coord_y)>1 || numel(ivar_coord_z)>1
    144         errormsg='multiply defined coordinates  in the same cell';
    145         return
    146     end
    147     if numel(ivar_errorflag)>1
    148         errormsg='multiply defined error flag in the same cell';
    149         return
    150     end
    151     if numel(ivar_warnflag)>1
    152         errormsg='multiply defined warning flag in the same cell';
    153         return
    154     end
    155     test_coord=0;
    156     if numel(VarIndex)>1     
    157         if ~isempty(ivar_coord_z)
    158             NbDim(icell)=3;
    159             test_coord=1;
    160         elseif ~isempty(ivar_coord_y)
    161             NbDim(icell)=2;
    162             test_coord=1;
    163         elseif ~isempty(ivar_coord_x)
    164             NbDim(icell)=1;
    165             test_coord=1;
    166         end
    167     end
    168     % look at coordinates variables 
    169     coord=zeros(1,numel(DimCell));%default
    170 %     if NbDim(icell)==0 && ~isempty(VarDimName)% no unstructured coordinate found
    171     if  ~test_coord && ~isempty(VarDimName)
    172         for idim=1:numel(DimCell)   %loop on the dimensions of the variables in cell #icell
    173             for ivardim=1:numel(VarDimName)
    174                 if strcmp(VarDimName{ivardim},DimCell{idim})
    175                     coord(idim)=VarDimIndex(ivardim);
    176                     break
    177                 end
    178             end
    179         end
    180         NbDim(icell)=numel(find(coord)); 
    181     end 
    182     VarType{icell}.coord=coord;
    183     if NbDim(icell)==0 && test_2D %look at attributes Coord_1, coord_2 (obsolete convention)
    184         NbDim(icell)=2;     
    185     end
    186     %look for tps data
    187     if ~isempty(VarType{icell}.coord_tps)
    188         VarType{icell}.var_tps=[];
    189         tps_dimnames=Data.VarDimName{VarType{icell}.coord_tps};
    190         if length(tps_dimnames)==3
    191             for ilist=1:length(Data.VarDimName)
    192                 if strcmp(tps_dimnames{1},Data.VarDimName{ilist}{1}) && strcmp(tps_dimnames{3},Data.VarDimName{ilist}{2})% identify the variables corresponding to the tps site coordinates coord_tps
    193                     VarType{icell}.var_tps=[VarType{icell}.var_tps ilist];
    194                 elseif length(Data.VarDimName{ilist})==1 && strcmp(tps_dimnames{3},Data.VarDimName{ilist}{1})% identify the variable corresponding to nbsites
    195                     VarType{icell}.nbsites_tps= ilist;
    196                 elseif length(Data.VarDimName{ilist})==3 && strcmp(tps_dimnames{2},Data.VarDimName{ilist}{1})&& strcmp(tps_dimnames{3},Data.VarDimName{ilist}{3})% identify the variable subrange
    197                     VarType{icell}.subrange_tps= ilist;
    198                 end
    199             end
    200         end
    201         NbDim(icell)=2;
    202     end 
    203 end
     247            end
     248            NbDim(icell)=numel(find(coord));
     249        end
     250        CellVarType{icell}.coord=coord;
     251        %look for tps data
     252        if ~isempty(VarType.coord_tps)
     253            for ilist=1:numel(VarType.coord_tps)
     254            tps_dimnames=Data.VarDimName{VarType.coord_tps(ilist)};
     255            if length(tps_dimnames)==3 && strcmp(tps_dimnames{1},DimCell{1}) && strcmp(tps_dimnames{3},DimCell{2})
     256                CellVarIndex{icell}=[CellVarIndex{icell} VarType.coord_tps(ilist) VarType.nbsites_tps(ilist) VarType.subrange_tps(ilist)];
     257                CellVarType{icell}.coord_tps=VarType.coord_tps(ilist);
     258                CellVarType{icell}.nbsites_tps=VarType.nbsites_tps(ilist);
     259                CellVarType{icell}.subrange_tps=VarType.subrange_tps(ilist);
     260                NbDim(icell)=size(Data.(Data.ListVarName{VarType.coord_tps(ilist)}),2);
     261            end
     262            end
     263        end
     264    end
     265end
     266if ~isempty(index_remove)
     267    CellVarIndex(index_remove)=[];
     268    CellVarType(index_remove)=[];
     269    NbDim(index_remove)=[];
     270end

  • trunk/src/proj_field.m

    r445 r491  
    970970ProjData.ListVarName={};
    971971ProjData.VarDimName={};
     972ProjData.VarAttribute={};
    972973if ~isequal(DX,0)&& ~isequal(DY,0)
    973974    ProjData.Mesh=sqrt(DX*DY);%define typical data mesh, useful for mouse selection in plots
    … …  
    10041005    VarIndex=CellVarIndex{icell};%  indices of the selected variables in the list FieldData.ListVarName
    10051006    VarType=VarTypeCell{icell};
    1006     ivar_X=VarType.coord_x;
    1007     ivar_Y=VarType.coord_y;
    1008     ivar_Z=VarType.coord_z;
     1007%     ivar_X=VarType.coord_x;
     1008%     ivar_Y=VarType.coord_y;
     1009%     ivar_Z=VarType.coord_z;
    10091010    ivar_U=VarType.vector_x;
    10101011    ivar_V=VarType.vector_y;
     1012    if ~isempty(VarType.vector_x_tps)&&~isempty(VarType.vector_y_tps)
     1013        ivar_U=VarType.vector_x_tps;
     1014        ivar_V=VarType.vector_y_tps;
     1015    end
    10111016    ivar_W=VarType.vector_z;
    1012     %    ivar_C=VarType.scalar ;
    1013     ivar_Anc=VarType.ancillary;
    1014     test_anc=zeros(size(VarIndex));
    1015     test_anc(ivar_Anc)=ones(size(ivar_Anc));
    1016     ivar_F=VarType.warnflag;
    1017     ivar_FF=VarType.errorflag;
    1018     check_unstructured_coord=(~isempty(ivar_X) && ~isempty(ivar_Y))||~isempty(VarType.coord_tps);
     1017%     ivar_Anc=VarType.ancillary;
     1018%     test_anc=zeros(size(VarIndex));
     1019%     test_anc(ivar_Anc)=ones(size(ivar_Anc));
     1020%     ivar_F=VarType.warnflag;
     1021%     ivar_FF=VarType.errorflag;
     1022
     1023    %type of coordinates
     1024    if ~isempty(VarType.coord_x) && ~isempty(VarType.coord_y)
     1025        CoordType='unstructured';
     1026    elseif ~isempty(VarType.coord_tps)
     1027        CoordType='tps';
     1028    else
     1029        CoordType='structured';
     1030    end
     1031   
     1032    %dimensions
    10191033    DimCell=FieldData.VarDimName{VarIndex(1)};
    10201034    if ischar(DimCell)
    10211035        DimCell={DimCell};%name of dimensions
    10221036    end
     1037    coord_z=0;%default
    10231038   
    1024     %% case of input fields with unstructured coordinates
    1025     coord_z=0;%default
    1026     if check_unstructured_coord
    1027         if ~isempty(ivar_X)% case of tps excluded. TODO similar procedure
    1028             XName=FieldData.ListVarName{ivar_X};
    1029             YName=FieldData.ListVarName{ivar_Y};
    1030             coord_x=FieldData.(XName);
    1031             coord_y=FieldData.(YName);
    1032             if length(ivar_Z)==1
    1033                 ZName=FieldData.ListVarName{ivar_Z};
    1034                 coord_z=FieldData.(ZName);
     1039    %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
     1040    switch CoordType
     1041       
     1042        %% case of input fields with unstructured coordinates
     1043        case 'unstructured'
     1044            if strcmp(ObjectData.ProjMode,'filter')
     1045                continue %skip for filter (needs tps)
     1046            end
     1047            coord_x=FieldData.(FieldData.ListVarName{VarType.coord_x});
     1048            coord_y=FieldData.(FieldData.ListVarName{VarType.coord_y});
     1049            if ~isempty(VarType.coord_z)
     1050                coord_z=FieldData.(FieldData.ListVarName{VarType.coord_z});
    10351051            end
    10361052           
    … …  
    10381054            coord_x=coord_x-ObjectData.Coord(1,1);
    10391055            coord_y=coord_y-ObjectData.Coord(1,2);
    1040             if ~isempty(ivar_Z)
     1056            if ~isempty(VarType.coord_z)
    10411057                coord_z=coord_z-ObjectData.Coord(1,3);
    10421058            end
    10431059           
    10441060            % selection of the vectors in the projection range (3D case)
    1045             if length(ivar_Z)==1 &&  width > 0
     1061            if ~isempty(VarType.coord_z) &&  width > 0
    10461062                %components of the unitiy vector normal to the projection plane
    10471063                fieldZ=norm_plane(1)*coord_x + norm_plane(2)*coord_y+ norm_plane(3)*coord_z;% distance to the plane
    … …  
    11051121                coord_X=coord_X(indcut);
    11061122                coord_Y=coord_Y(indcut);
    1107                 if length(ivar_Z)==1
     1123                if ~isempty(VarType.coord_z)
    11081124                    coord_Z=coord_Z(indcut);
    11091125                end
    11101126            end
    1111         end
    1112         % different cases of projection
    1113         switch ObjectData.ProjMode
    1114             case 'projection'
    1115                 for ivar=VarIndex %transfer variables to the projection plane
    1116                     VarName=FieldData.ListVarName{ivar};
    1117                     if ivar==ivar_X %x coordinate
    1118                         eval(['ProjData.' VarName '=coord_X;'])
    1119                     elseif ivar==ivar_Y % y coordinate
    1120                         eval(['ProjData.' VarName '=coord_Y;'])
    1121                     elseif isempty(ivar_Z) || ivar~=ivar_Z % other variables (except Z coordinate wyhich is not reproduced)
    1122                         eval(['ProjData.' VarName '=FieldData.' VarName ';'])
    1123                     end
    1124                     if isempty(ivar_Z) || ivar~=ivar_Z
    1125                         ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName VarName];
    1126                         ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName DimCell];
    1127                         nbvar=nbvar+1;
    1128                         if isfield(FieldData,'VarAttribute') && length(FieldData.VarAttribute) >=ivar
    1129                             ProjData.VarAttribute{nbvar}=FieldData.VarAttribute{ivar};
     1127           
     1128            % different cases of projection
     1129            switch ObjectData.ProjMode
     1130                case 'projection'
     1131                    for ivar=VarIndex %transfer variables to the projection plane
     1132                        VarName=FieldData.ListVarName{ivar};
     1133                        if ivar==VarType.coord_x %x coordinate
     1134                            ProjData.(VarName)=coord_X;
     1135                        elseif ivar==VarType.coord_y  % y coordinate
     1136                            ProjData.(VarName)=coord_Y;
     1137                        elseif isempty(VarType.coord_z) || ivar~=VarType.coord_z % other variables (except Z coordinate wyhich is not reproduced)
     1138                            ProjData.(VarName)=FieldData.(VarName);
    11301139                        end
    1131                     end
    1132                 end
    1133             case 'interp'%interpolate data on a regular grid
     1140                        if isempty(VarType.coord_z) || ivar~=VarType.coord_z
     1141                            ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName VarName];
     1142                            ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName DimCell];
     1143                            nbvar=nbvar+1;
     1144                            if isfield(FieldData,'VarAttribute') && length(FieldData.VarAttribute) >=ivar
     1145                                ProjData.VarAttribute{nbvar}=FieldData.VarAttribute{ivar};
     1146                            end
     1147                        end
     1148                    end
     1149                case 'interp'%interpolate data on a regular grid
     1150                    coord_x_proj=XMin:DX:XMax;
     1151                    coord_y_proj=YMin:DY:YMax;
     1152                    DimCell={'coord_y','coord_x'};
     1153                    ProjData.ListVarName={'coord_y','coord_x'};
     1154                    ProjData.VarDimName={'coord_y','coord_x'};
     1155                    nbcoord=2;
     1156                    ProjData.coord_y=[YMin YMax];
     1157                    ProjData.coord_x=[XMin XMax];
     1158%                     if isempty(ivar_X), ivar_X=0; end;
     1159%                     if isempty(ivar_Y), ivar_Y=0; end;
     1160%                     if isempty(ivar_Z), ivar_Z=0; end;
     1161%                     if isempty(ivar_U), ivar_U=0; end;
     1162%                     if isempty(ivar_V), ivar_V=0; end;
     1163%                     if isempty(ivar_W), ivar_W=0; end;
     1164%                     if isempty(ivar_F), ivar_F=0; end;
     1165%                     if isempty(ivar_FF), ivar_FF=0; end;
     1166                  %  if ~isequal(ivar_FF,0)
     1167                   if ~isempty(VarType.errorflag)
     1168                        VarName_FF=FieldData.ListVarName{VarType.errorflag};
     1169                        indsel=find(FieldData.(VarName_FF)==0);
     1170                        coord_X=coord_X(indsel);
     1171                        coord_Y=coord_Y(indsel);
     1172                    end
     1173                   
     1174                    FF=zeros(1,length(coord_y_proj)*length(coord_x_proj));
     1175                    testFF=0;
     1176                    %for ivar=VarIndex % loop on field variables to project
     1177                    for ivar=[VarType.scalar VarType.vector_x VarType.vector_y]
     1178                        VarName=FieldData.ListVarName{ivar};
     1179%                         if ~( ivar==ivar_X || ivar==ivar_Y || ivar==ivar_Z || ivar==ivar_F || ivar==ivar_FF ||...
     1180%                                 ( numel(test_anc)>=ivar && test_anc(ivar)==1))
     1181                            ivar_new=ivar_new+1;
     1182                            ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName {VarName}];
     1183                            ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName {DimCell}];
     1184                            if isfield(FieldData,'VarAttribute') && length(FieldData.VarAttribute) >=ivar
     1185                                ProjData.VarAttribute{ivar_new+nbcoord}=FieldData.VarAttribute{ivar};
     1186                            end
     1187                            %if  ~isequal(ivar_FF,0)
     1188                            if ~isempty(VarType.errorflag)
     1189                                FieldData.(VarName)=FieldData.(VarName)(indsel);
     1190                            end
     1191                            ProjData.(VarName)=griddata_uvmat(double(coord_X),double(coord_Y),double(FieldData.(VarName)),coord_x_proj,coord_y_proj');
     1192                            varline=reshape(ProjData.(VarName),1,length(coord_y_proj)*length(coord_x_proj));
     1193                            FFlag= isnan(varline); %detect undefined values NaN
     1194                            indnan=find(FFlag);
     1195                            if~isempty(indnan)
     1196                                varline(indnan)=zeros(size(indnan));
     1197                                ProjData.(VarName)=reshape(varline,length(coord_y_proj),length(coord_x_proj));
     1198                                FF(indnan)=ones(size(indnan));
     1199                                testFF=1;
     1200                            end
     1201                            if ivar==ivar_U
     1202                                ivar_U=ivar_new;
     1203                            end
     1204                            if ivar==ivar_V
     1205                                ivar_V=ivar_new;
     1206                            end
     1207                            if ivar==ivar_W
     1208                                ivar_W=ivar_new;
     1209                            end
     1210%                         end
     1211                    end
     1212                    if testFF
     1213                        ProjData.FF=reshape(FF,length(coord_y_proj),length(coord_x_proj));
     1214                        ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName {'FF'}];
     1215                        ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName {DimCell}];
     1216                        ProjData.VarAttribute{ivar_new+1+nbcoord}.Role='errorflag';
     1217                    end
     1218            end
     1219           
     1220            %% case of tps interpolation (applies only in filter mode)
     1221        case 'tps'
     1222            if strcmp(ObjectData.ProjMode,'filter')
    11341223                coord_x_proj=XMin:DX:XMax;
    11351224                coord_y_proj=YMin:DY:YMax;
    1136                 DimCell={'coord_y','coord_x'};
    1137                 ProjData.ListVarName={'coord_y','coord_x'};
    1138                 ProjData.VarDimName={'coord_y','coord_x'};
    1139                 nbcoord=2;
     1225                np_x=numel(coord_x_proj);
     1226                np_y=numel(coord_y_proj);
     1227                [XI,YI]=meshgrid(coord_x_proj,coord_y_proj');
     1228                XI=XI+ObjectData.Coord(1,1);
     1229                YI=YI+ObjectData.Coord(1,2);
     1230                DataOut=calc_field(FieldData.FieldList,FieldData,cat(3,XI,YI));
     1231                ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName DataOut.ListVarName];
     1232                ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName DataOut.VarDimName];
     1233                ProjData.VarAttribute=[ProjData.VarAttribute DataOut.VarAttribute];   
     1234                for ilist=1:length(DataOut.ListVarName)% reshape data, excluding coordinates (ilist=1-2), TODO: rationalise
     1235                    VarName=DataOut.ListVarName{ilist};
     1236%                     ProjData.(VarName)=DataOut.(VarName);
     1237                    if ilist>=3
     1238                    ProjData.(VarName)=reshape(DataOut.(VarName),np_y,np_x);
     1239                    end
     1240                end
     1241                ProjData.coord_x=[XMin XMax];
    11401242                ProjData.coord_y=[YMin YMax];
    1141                 ProjData.coord_x=[XMin XMax];
    1142                 if isempty(ivar_X), ivar_X=0; end;
    1143                 if isempty(ivar_Y), ivar_Y=0; end;
    1144                 if isempty(ivar_Z), ivar_Z=0; end;
    1145                 if isempty(ivar_U), ivar_U=0; end;
    1146                 if isempty(ivar_V), ivar_V=0; end;
    1147                 if isempty(ivar_W), ivar_W=0; end;
    1148                 if isempty(ivar_F), ivar_F=0; end;
    1149                 if isempty(ivar_FF), ivar_FF=0; end;
    1150                 if ~isequal(ivar_FF,0)
    1151                     VarName_FF=FieldData.ListVarName{ivar_FF};
    1152                     indsel=find(FieldData.(VarName_FF)==0);
    1153                     coord_X=coord_X(indsel);
    1154                     coord_Y=coord_Y(indsel);
    1155                 end
    1156                
    1157                 FF=zeros(1,length(coord_y_proj)*length(coord_x_proj));
    1158                 testFF=0;
    1159                 for ivar=VarIndex
    1160                     VarName=FieldData.ListVarName{ivar};
    1161                     if ~( ivar==ivar_X || ivar==ivar_Y || ivar==ivar_Z || ivar==ivar_F || ivar==ivar_FF ||...
    1162                            ( numel(test_anc)>=ivar && test_anc(ivar)==1))
    1163                         ivar_new=ivar_new+1;
    1164                         ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName {VarName}];
    1165                         ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName {DimCell}];
    1166                         if isfield(FieldData,'VarAttribute') && length(FieldData.VarAttribute) >=ivar
    1167                             ProjData.VarAttribute{ivar_new+nbcoord}=FieldData.VarAttribute{ivar};
     1243            end
     1244           
     1245            %% case of input fields defined on a structured  grid
     1246        case 'structured'
     1247           
     1248            VarName=FieldData.ListVarName{VarIndex(1)};%get the first variable of the cell to get the input matrix dimensions
     1249            eval(['DimValue=size(FieldData.' VarName ');'])%input matrix dimensions
     1250            DimValue(DimValue==1)=[];%remove singleton dimensions
     1251            NbDim=numel(DimValue);%update number of space dimensions
     1252            nbcolor=1; %default number of 'color' components: third matrix index without corresponding coordinate
     1253            if NbDim>=3
     1254                if NbDim>3
     1255                    errormsg='matrices with more than 3 dimensions not handled';
     1256                    return
     1257                else
     1258                    if numel(find(VarType.coord))==2% the third matrix dimension does not correspond to a space coordinate
     1259                        nbcolor=DimValue(3);
     1260                        DimValue(3)=[]; %number of 'color' components updated
     1261                        NbDim=2;% space dimension set to 2
     1262                    end
     1263                end
     1264            end
     1265            AYName=FieldData.ListVarName{VarType.coord(NbDim-1)};%name of input x coordinate (name preserved on projection)
     1266            AXName=FieldData.ListVarName{VarType.coord(NbDim)};%name of input y coordinate (name preserved on projection)
     1267            if testangle% TODO modify name also in case of origin shift in x or y
     1268                AYProjName='Y';
     1269                AXProjName='X';
     1270                count=0;
     1271                %modify coordinate names if they are already used
     1272                while ~(isempty(find(strcmp('AXName',ProjData.ListVarName),1)) && isempty(find(strcmp('AYName',ProjData.ListVarName),1)))
     1273                    count=count+1;
     1274                    AYProjName=[AYProjName '_' num2str(count)];
     1275                    AXProjName=[AXProjName '_' num2str(count)];
     1276                end
     1277            else
     1278                AYProjName=AYName;% (name preserved on projection)
     1279                AXProjName=AXName;%name of input y coordinate (name preserved on projection)
     1280            end
     1281            ListDimName=FieldData.VarDimName{VarIndex(1)};
     1282            ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName {AYProjName} {AXProjName}]; %TODO: check if it already exists in Projdata (several cells)
     1283            ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName {AYProjName} {AXProjName}];
     1284            Coord_z=[];
     1285            Coord_y=[];
     1286            Coord_x=[];
     1287           
     1288            for idim=1:NbDim %loop on space dimensions
     1289                test_interp(idim)=0;%test for coordiate interpolation (non regular grid), =0 by default
     1290                ivar=VarType.coord(idim);% index of the variable corresponding to the current dimension
     1291                if ~isequal(ivar,0)%  a variable corresponds to the dimension #idim
     1292                    eval(['Coord{idim}=FieldData.' FieldData.ListVarName{ivar} ';']) ;% coord values for the input field
     1293                    if numel(Coord{idim})==2 %input array defined on a regular grid
     1294                        DCoord_min(idim)=(Coord{idim}(2)-Coord{idim}(1))/DimValue(idim);
     1295                    else
     1296                        DCoord=diff(Coord{idim});%array of coordinate derivatives for the input field
     1297                        DCoord_min(idim)=min(DCoord);
     1298                        DCoord_max=max(DCoord);
     1299                        %    test_direct(idim)=DCoord_max>0;% =1 for increasing values, 0 otherwise
     1300                        if abs(DCoord_max-DCoord_min(idim))>abs(DCoord_max/1000)
     1301                            msgbox_uvmat('ERROR',['non monotonic dimension variable # ' num2str(idim)  ' in proj_field.m'])
     1302                            return
    11681303                        end
    1169                         if  ~isequal(ivar_FF,0)
    1170                             FieldData.(VarName)=FieldData.(VarName)(indsel);
     1304                        test_interp(idim)=(DCoord_max-DCoord_min(idim))> 0.0001*abs(DCoord_max);% test grid regularity
     1305                    end
     1306                    test_direct(idim)=(DCoord_min(idim)>0);
     1307                else  % no variable associated with the  dimension #idim, the coordinate value is set equal to the matrix index by default
     1308                    Coord_i_str=['Coord_' num2str(idim)];
     1309                    DCoord_min(idim)=1;%default
     1310                    Coord{idim}=[0.5 DimValue(idim)-0.5];
     1311                    test_direct(idim)=1;
     1312                end
     1313            end
     1314            if DY==0
     1315                DY=abs(DCoord_min(NbDim-1));
     1316            end
     1317            npY=1+round(abs(Coord{NbDim-1}(end)-Coord{NbDim-1}(1))/DY);%nbre of points after interpol
     1318            if DX==0
     1319                DX=abs(DCoord_min(NbDim));
     1320            end
     1321            npX=1+round(abs(Coord{NbDim}(end)-Coord{NbDim}(1))/DX);%nbre of points after interpol
     1322            for idim=1:NbDim
     1323                if test_interp(idim)
     1324                    DimValue(idim)=1+round(abs(Coord{idim}(end)-Coord{idim}(1))/abs(DCoord_min(idim)));%nbre of points after possible interpolation on a regular gri
     1325                end
     1326            end
     1327            Coord_y=linspace(Coord{NbDim-1}(1),Coord{NbDim-1}(end),npY);
     1328            test_direct_y=test_direct(NbDim-1);
     1329            Coord_x=linspace(Coord{NbDim}(1),Coord{NbDim}(end),npX);
     1330            test_direct_x=test_direct(NbDim);
     1331            DAX=DCoord_min(NbDim);
     1332            DAY=DCoord_min(NbDim-1);
     1333            minAX=min(Coord_x);
     1334            maxAX=max(Coord_x);
     1335            minAY=min(Coord_y);
     1336            maxAY=max(Coord_y);
     1337            xcorner=[minAX maxAX minAX maxAX]-ObjectData.Coord(1,1);
     1338            ycorner=[maxAY maxAY minAY minAY]-ObjectData.Coord(1,2);
     1339            xcor_new=xcorner*cos_om+ycorner*sin_om;%coord new frame
     1340            ycor_new=-xcorner*sin_om+ycorner*cos_om;
     1341            if ~testXMax
     1342                XMax=max(xcor_new);
     1343            end
     1344            if ~testXMin
     1345                XMin=min(xcor_new);
     1346            end
     1347            if ~testYMax
     1348                YMax=max(ycor_new);
     1349            end
     1350            if ~testYMin
     1351                YMin=min(ycor_new);
     1352            end
     1353            DXinit=(maxAX-minAX)/(DimValue(NbDim)-1);
     1354            DYinit=(maxAY-minAY)/(DimValue(NbDim-1)-1);
     1355            if DX==0
     1356                DX=DXinit;
     1357            end
     1358            if DY==0
     1359                DY=DYinit;
     1360            end
     1361            if NbDim==3
     1362                DZ=(Coord{1}(end)-Coord{1}(1))/(DimValue(1)-1);
     1363                if ~test_direct(1)
     1364                    DZ=-DZ;
     1365                end
     1366                Coord_z=linspace(Coord{1}(1),Coord{1}(end),DimValue(1));
     1367                test_direct_z=test_direct(1);
     1368            end
     1369            npX=floor((XMax-XMin)/DX+1);
     1370            npY=floor((YMax-YMin)/DY+1);
     1371            if test_direct_y
     1372                coord_y_proj=linspace(YMin,YMax,npY);%abscissa of the new pixels along the line
     1373            else
     1374                coord_y_proj=linspace(YMax,YMin,npY);%abscissa of the new pixels along the line
     1375            end
     1376            if test_direct_x
     1377                coord_x_proj=linspace(XMin,XMax,npX);%abscissa of the new pixels along the line
     1378            else
     1379                coord_x_proj=linspace(XMax,XMin,npX);%abscissa of the new pixels along the line
     1380            end
     1381            % case with no  interpolation
     1382            if isequal(ProjMode,'projection') && (~testangle || test90y || test90x)
     1383                if  NbDim==2 && ~testXMin && ~testXMax && ~testYMin && ~testYMax
     1384                    ProjData=FieldData;% no change by projection
     1385                else
     1386                    indY=NbDim-1;
     1387                    if test_direct(indY)
     1388                        min_indy=ceil((YMin-Coord{indY}(1))/DYinit)+1;
     1389                        max_indy=floor((YMax-Coord{indY}(1))/DYinit)+1;
     1390                        Ybound(1)=Coord{indY}(1)+DYinit*(min_indy-1);
     1391                        Ybound(2)=Coord{indY}(1)+DYinit*(max_indy-1);
     1392                    else
     1393                        min_indy=ceil((Coord{indY}(1)-YMax)/DYinit)+1;
     1394                        max_indy=floor((Coord{indY}(1)-YMin)/DYinit)+1;
     1395                        Ybound(2)=Coord{indY}(1)-DYinit*(max_indy-1);
     1396                        Ybound(1)=Coord{indY}(1)-DYinit*(min_indy-1);
     1397                    end
     1398                    if test_direct(NbDim)==1
     1399                        min_indx=ceil((XMin-Coord{NbDim}(1))/DXinit)+1;
     1400                        max_indx=floor((XMax-Coord{NbDim}(1))/DXinit)+1;
     1401                        Xbound(1)=Coord{NbDim}(1)+DXinit*(min_indx-1);
     1402                        Xbound(2)=Coord{NbDim}(1)+DXinit*(max_indx-1);
     1403                    else
     1404                        min_indx=ceil((Coord{NbDim}(1)-XMax)/DXinit)+1;
     1405                        max_indx=floor((Coord{NbDim}(1)-XMin)/DXinit)+1;
     1406                        Xbound(2)=Coord{NbDim}(1)+DXinit*(max_indx-1);
     1407                        Xbound(1)=Coord{NbDim}(1)+DXinit*(min_indx-1);
     1408                    end
     1409                    min_indy=max(min_indy,1);% deals with margin (bound lower than the first index)
     1410                    min_indx=max(min_indx,1);
     1411                   
     1412                    if test90y
     1413                        ind_new=[3 2 1];
     1414                        DimCell={AYProjName,AXProjName};
     1415                        %                     DimValue=DimValue(ind_new);
     1416                        iz=ceil((ObjectData.Coord(1,1)-Coord{3}(1))/DX)+1;
     1417                        for ivar=VarIndex
     1418                            VarName=FieldData.ListVarName{ivar};
     1419                            ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName VarName];
     1420                            ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName {DimCell}];
     1421                            ProjData.VarAttribute{length(ProjData.ListVarName)}=FieldData.VarAttribute{ivar}; %reproduce the variable attributes
     1422                            eval(['ProjData.' VarName '=permute(FieldData.' VarName ',ind_new);'])% permute x and z indices for 90 degree rotation
     1423                            eval(['ProjData.' VarName '=squeeze(ProjData.' VarName '(iz,:,:));'])% select the z index iz
    11711424                        end
    1172                         ProjData.(VarName)=griddata_uvmat(double(coord_X),double(coord_Y),double(FieldData.(VarName)),coord_x_proj,coord_y_proj');
    1173                         varline=reshape(ProjData.(VarName),1,length(coord_y_proj)*length(coord_x_proj));
    1174                         FFlag= isnan(varline); %detect undefined values NaN
    1175                         indnan=find(FFlag);
    1176                         if~isempty(indnan)
    1177                             varline(indnan)=zeros(size(indnan));
    1178                             ProjData.(VarName)=reshape(varline,length(coord_y_proj),length(coord_x_proj));
    1179                             FF(indnan)=ones(size(indnan));
    1180                             testFF=1;
     1425                        eval(['ProjData.' AYProjName '=[Ybound(1) Ybound(2)];']) %record the new (projected ) y coordinates
     1426                        eval(['ProjData.' AXProjName '=[Coord{1}(end),Coord{1}(1)];']) %record the new (projected ) x coordinates
     1427                    else
     1428                        if NbDim==3
     1429                            DimCell(1)=[]; %suppress z variable
     1430                            DimValue(1)=[];
     1431                            if test_direct(1)
     1432                                iz=ceil((ObjectData.Coord(1,3)-Coord{1}(1))/DZ)+1;
     1433                            else
     1434                                iz=ceil((Coord{1}(1)-ObjectData.Coord(1,3))/DZ)+1;
     1435                            end
    11811436                        end
    1182                         if ivar==ivar_U
    1183                             ivar_U=ivar_new;
     1437                        max_indy=min(max_indy,DimValue(1));%introduce bounds in y and x indices
     1438                        max_indx=min(max_indx,DimValue(2));
     1439                        for ivar=VarIndex% loop on non coordinate variables
     1440                            VarName=FieldData.ListVarName{ivar};
     1441                            ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName VarName];
     1442                            ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName {DimCell}];
     1443                            if isfield(FieldData,'VarAttribute') && length(FieldData.VarAttribute)>=ivar
     1444                                ProjData.VarAttribute{length(ProjData.ListVarName)}=FieldData.VarAttribute{ivar};
     1445                            end
     1446                            if NbDim==3
     1447                                eval(['ProjData.' VarName '=squeeze(FieldData.' VarName '(iz,min_indy:max_indy,min_indx:max_indx));']);
     1448                            else
     1449                                eval(['ProjData.' VarName '=FieldData.' VarName '(min_indy:max_indy,min_indx:max_indx,:);']);
     1450                            end
    11841451                        end
    1185                         if ivar==ivar_V
    1186                             ivar_V=ivar_new;
    1187                         end
    1188                         if ivar==ivar_W
    1189                             ivar_W=ivar_new;
    1190                         end
    1191                     end
    1192                 end
    1193                 if testFF
    1194                     ProjData.FF=reshape(FF,length(coord_y_proj),length(coord_x_proj));
    1195                     ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName {'FF'}];
    1196                     ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName {DimCell}];
    1197                     ProjData.VarAttribute{ivar_new+1+nbcoord}.Role='errorflag';
    1198                 end
    1199             case 'filter'
    1200                 if ~isempty(VarType.coord_tps)
    1201                      %Coord_tps=FieldData.ListVarName{VarType.coord_tps};
    1202                      %TODO: possibly translate and rotate coordiantes translate  initial coordinates
    1203                     coord_x_proj=XMin:DX:XMax;
    1204                     coord_y_proj=YMin:DY:YMax;
    1205                     np_x=numel(coord_x_proj);
    1206                     np_y=numel(coord_y_proj);
    1207                     [XI,YI]=meshgrid(coord_x_proj,coord_y_proj');
    1208                     XI=reshape(XI,[],1)+ObjectData.Coord(1,1);
    1209                     YI=reshape(YI,[],1)+ObjectData.Coord(1,2);
    1210                     ProjData=calc_field(FieldData.FieldList,FieldData,[XI YI]);
    1211                     for ilist=3:length(ProjData.ListVarName)% reshape data, excluding coordinates (ilist=1-2), TODO: rationalise
    1212                         VarName=ProjData.ListVarName{ilist};
    1213                         ProjData.(VarName)=reshape(ProjData.(VarName),np_y,np_x);
    1214                     end
    1215                     ProjData.coord_x=[XMin XMax];
    1216                     ProjData.coord_y=[YMin YMax];
    1217                 end
    1218         end
    1219         %% case of input fields defined on a structured  grid
    1220     else
    1221         VarName=FieldData.ListVarName{VarIndex(1)};%get the first variable of the cell to get the input matrix dimensions
    1222         eval(['DimValue=size(FieldData.' VarName ');'])%input matrix dimensions
    1223         DimValue(DimValue==1)=[];%remove singleton dimensions
    1224         NbDim=numel(DimValue);%update number of space dimensions
    1225         nbcolor=1; %default number of 'color' components: third matrix index without corresponding coordinate
    1226         if NbDim>=3
    1227             if NbDim>3
    1228                 errormsg='matrices with more than 3 dimensions not handled';
    1229                 return
    1230             else
    1231                 if numel(find(VarType.coord))==2% the third matrix dimension does not correspond to a space coordinate
    1232                     nbcolor=DimValue(3);
    1233                     DimValue(3)=[]; %number of 'color' components updated
    1234                     NbDim=2;% space dimension set to 2
    1235                 end
    1236             end
    1237         end
    1238         AYName=FieldData.ListVarName{VarType.coord(NbDim-1)};%name of input x coordinate (name preserved on projection)
    1239         AXName=FieldData.ListVarName{VarType.coord(NbDim)};%name of input y coordinate (name preserved on projection)
    1240         if testangle% TODO modify name also in case of origin shift in x or y
    1241             AYProjName='Y';
    1242             AXProjName='X';
    1243             count=0;
    1244             %modify coordinate names if they are already used
    1245             while ~(isempty(find(strcmp('AXName',ProjData.ListVarName),1)) && isempty(find(strcmp('AYName',ProjData.ListVarName),1)))
    1246                 count=count+1;
    1247                 AYProjName=[AYProjName '_' num2str(count)];
    1248                 AXProjName=[AXProjName '_' num2str(count)];
    1249             end
    1250         else
    1251             AYProjName=AYName;% (name preserved on projection)
    1252             AXProjName=AXName;%name of input y coordinate (name preserved on projection)
    1253         end
    1254         ListDimName=FieldData.VarDimName{VarIndex(1)};
    1255         ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName {AYProjName} {AXProjName}]; %TODO: check if it already exists in Projdata (several cells)
    1256         ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName {AYProjName} {AXProjName}];
    1257         Coord_z=[];
    1258         Coord_y=[];
    1259         Coord_x=[];
    1260        
    1261         for idim=1:NbDim %loop on space dimensions
    1262             test_interp(idim)=0;%test for coordiate interpolation (non regular grid), =0 by default
    1263             ivar=VarType.coord(idim);% index of the variable corresponding to the current dimension
    1264             if ~isequal(ivar,0)%  a variable corresponds to the dimension #idim
    1265                 eval(['Coord{idim}=FieldData.' FieldData.ListVarName{ivar} ';']) ;% coord values for the input field
    1266                 if numel(Coord{idim})==2 %input array defined on a regular grid
    1267                     DCoord_min(idim)=(Coord{idim}(2)-Coord{idim}(1))/DimValue(idim);
    1268                 else
    1269                     DCoord=diff(Coord{idim});%array of coordinate derivatives for the input field
    1270                     DCoord_min(idim)=min(DCoord);
    1271                     DCoord_max=max(DCoord);
    1272                     %    test_direct(idim)=DCoord_max>0;% =1 for increasing values, 0 otherwise
    1273                     if abs(DCoord_max-DCoord_min(idim))>abs(DCoord_max/1000)
    1274                         msgbox_uvmat('ERROR',['non monotonic dimension variable # ' num2str(idim)  ' in proj_field.m'])
    1275                         return
    1276                     end
    1277                     test_interp(idim)=(DCoord_max-DCoord_min(idim))> 0.0001*abs(DCoord_max);% test grid regularity
    1278                 end
    1279                 test_direct(idim)=(DCoord_min(idim)>0);
    1280             else  % no variable associated with the  dimension #idim, the coordinate value is set equal to the matrix index by default
    1281                 Coord_i_str=['Coord_' num2str(idim)];
    1282                 DCoord_min(idim)=1;%default
    1283                 Coord{idim}=[0.5 DimValue(idim)-0.5];
    1284                 test_direct(idim)=1;
    1285             end
    1286         end
    1287         if DY==0
    1288             DY=abs(DCoord_min(NbDim-1));
    1289         end
    1290         npY=1+round(abs(Coord{NbDim-1}(end)-Coord{NbDim-1}(1))/DY);%nbre of points after interpol
    1291         if DX==0
    1292             DX=abs(DCoord_min(NbDim));
    1293         end
    1294         npX=1+round(abs(Coord{NbDim}(end)-Coord{NbDim}(1))/DX);%nbre of points after interpol
    1295         for idim=1:NbDim
    1296             if test_interp(idim)
    1297                 DimValue(idim)=1+round(abs(Coord{idim}(end)-Coord{idim}(1))/abs(DCoord_min(idim)));%nbre of points after possible interpolation on a regular gri
    1298             end
    1299         end
    1300         Coord_y=linspace(Coord{NbDim-1}(1),Coord{NbDim-1}(end),npY);
    1301         test_direct_y=test_direct(NbDim-1);
    1302         Coord_x=linspace(Coord{NbDim}(1),Coord{NbDim}(end),npX);
    1303         test_direct_x=test_direct(NbDim);
    1304         DAX=DCoord_min(NbDim);
    1305         DAY=DCoord_min(NbDim-1);
    1306         minAX=min(Coord_x);
    1307         maxAX=max(Coord_x);
    1308         minAY=min(Coord_y);
    1309         maxAY=max(Coord_y);
    1310         xcorner=[minAX maxAX minAX maxAX]-ObjectData.Coord(1,1);
    1311         ycorner=[maxAY maxAY minAY minAY]-ObjectData.Coord(1,2);
    1312         xcor_new=xcorner*cos_om+ycorner*sin_om;%coord new frame
    1313         ycor_new=-xcorner*sin_om+ycorner*cos_om;
    1314         if ~testXMax
    1315             XMax=max(xcor_new);
    1316         end
    1317         if ~testXMin
    1318             XMin=min(xcor_new);
    1319         end
    1320         if ~testYMax
    1321             YMax=max(ycor_new);
    1322         end
    1323         if ~testYMin
    1324             YMin=min(ycor_new);
    1325         end
    1326         DXinit=(maxAX-minAX)/(DimValue(NbDim)-1);
    1327         DYinit=(maxAY-minAY)/(DimValue(NbDim-1)-1);
    1328         if DX==0
    1329             DX=DXinit;
    1330         end
    1331         if DY==0
    1332             DY=DYinit;
    1333         end
    1334         if NbDim==3
    1335             DZ=(Coord{1}(end)-Coord{1}(1))/(DimValue(1)-1);
    1336             if ~test_direct(1)
    1337                 DZ=-DZ;
    1338             end
    1339             Coord_z=linspace(Coord{1}(1),Coord{1}(end),DimValue(1));
    1340             test_direct_z=test_direct(1);
    1341         end
    1342         npX=floor((XMax-XMin)/DX+1);
    1343         npY=floor((YMax-YMin)/DY+1);
    1344         if test_direct_y
    1345             coord_y_proj=linspace(YMin,YMax,npY);%abscissa of the new pixels along the line
    1346         else
    1347             coord_y_proj=linspace(YMax,YMin,npY);%abscissa of the new pixels along the line
    1348         end
    1349         if test_direct_x
    1350             coord_x_proj=linspace(XMin,XMax,npX);%abscissa of the new pixels along the line
    1351         else
    1352             coord_x_proj=linspace(XMax,XMin,npX);%abscissa of the new pixels along the line
    1353         end
    1354         % case with no  interpolation
    1355         if isequal(ProjMode,'projection') && (~testangle || test90y || test90x)
    1356             if  NbDim==2 && ~testXMin && ~testXMax && ~testYMin && ~testYMax
    1357                 ProjData=FieldData;% no change by projection
    1358             else
    1359                 indY=NbDim-1;
    1360                 if test_direct(indY)
    1361                     min_indy=ceil((YMin-Coord{indY}(1))/DYinit)+1;
    1362                     max_indy=floor((YMax-Coord{indY}(1))/DYinit)+1;
    1363                     Ybound(1)=Coord{indY}(1)+DYinit*(min_indy-1);
    1364                     Ybound(2)=Coord{indY}(1)+DYinit*(max_indy-1);
    1365                 else
    1366                     min_indy=ceil((Coord{indY}(1)-YMax)/DYinit)+1;
    1367                     max_indy=floor((Coord{indY}(1)-YMin)/DYinit)+1;
    1368                     Ybound(2)=Coord{indY}(1)-DYinit*(max_indy-1);
    1369                     Ybound(1)=Coord{indY}(1)-DYinit*(min_indy-1);
    1370                 end
    1371                 if test_direct(NbDim)==1
    1372                     min_indx=ceil((XMin-Coord{NbDim}(1))/DXinit)+1;
    1373                     max_indx=floor((XMax-Coord{NbDim}(1))/DXinit)+1;
    1374                     Xbound(1)=Coord{NbDim}(1)+DXinit*(min_indx-1);
    1375                     Xbound(2)=Coord{NbDim}(1)+DXinit*(max_indx-1);
    1376                 else
    1377                     min_indx=ceil((Coord{NbDim}(1)-XMax)/DXinit)+1;
    1378                     max_indx=floor((Coord{NbDim}(1)-XMin)/DXinit)+1;
    1379                     Xbound(2)=Coord{NbDim}(1)+DXinit*(max_indx-1);
    1380                     Xbound(1)=Coord{NbDim}(1)+DXinit*(min_indx-1);
    1381                 end
    1382                 min_indy=max(min_indy,1);% deals with margin (bound lower than the first index)
    1383                 min_indx=max(min_indx,1);
    1384                
    1385                 if test90y
    1386                     ind_new=[3 2 1];
    1387                     DimCell={AYProjName,AXProjName};
    1388                     %                     DimValue=DimValue(ind_new);
    1389                     iz=ceil((ObjectData.Coord(1,1)-Coord{3}(1))/DX)+1;
     1452                        eval(['ProjData.' AYProjName '=[Ybound(1) Ybound(2)];']) %record the new (projected ) y coordinates
     1453                        eval(['ProjData.' AXProjName '=[Xbound(1) Xbound(2)];']) %record the new (projected ) x coordinates
     1454                    end
     1455                end
     1456            else       % case with rotation and/or interpolation
     1457                if NbDim==2 %2D case
     1458                    [X,Y]=meshgrid(coord_x_proj,coord_y_proj);%grid in the new coordinates
     1459                    XIMA=ObjectData.Coord(1,1)+(X)*cos(PlaneAngle(3))-Y*sin(PlaneAngle(3));%corresponding coordinates in the original image
     1460                    YIMA=ObjectData.Coord(1,2)+(X)*sin(PlaneAngle(3))+Y*cos(PlaneAngle(3));
     1461                    XIMA=(XIMA-minAX)/DXinit+1;% image index along x
     1462                    YIMA=(-YIMA+maxAY)/DYinit+1;% image index along y
     1463                    XIMA=reshape(round(XIMA),1,npX*npY);%indices reorganized in 'line'
     1464                    YIMA=reshape(round(YIMA),1,npX*npY);
     1465                    flagin=XIMA>=1 & XIMA<=DimValue(2) & YIMA >=1 & YIMA<=DimValue(1);%flagin=1 inside the original image
     1466                    if isequal(ObjectData.ProjMode,'filter')
     1467                        npx_filter=ceil(abs(DX/DAX));
     1468                        npy_filter=ceil(abs(DY/DAY));
     1469                        Mfilter=ones(npy_filter,npx_filter)/(npx_filter*npy_filter);
     1470                        test_filter=1;
     1471                    else
     1472                        test_filter=0;
     1473                    end
     1474                    eval(['ProjData.' AYName '=[coord_y_proj(1) coord_y_proj(end)];']) %record the new (projected ) y coordinates
     1475                    eval(['ProjData.' AXName '=[coord_x_proj(1) coord_x_proj(end)];']) %record the new (projected ) x coordinates
    13901476                    for ivar=VarIndex
    13911477                        VarName=FieldData.ListVarName{ivar};
     1478                        if test_interp(1) || test_interp(2)%interpolate on a regular grid
     1479                            eval(['ProjData.' VarName '=interp2(Coord{2},Coord{1},FieldData.' VarName ',Coord_x,Coord_y'');']) %TO TEST
     1480                        end
     1481                        %filter the field (image) if option 'filter' is used
     1482                        if test_filter
     1483                            Aclass=class(FieldData.A);
     1484                            eval(['ProjData.' VarName '=filter2(Mfilter,FieldData.' VarName ',''valid'');'])
     1485                            if ~isequal(Aclass,'double')
     1486                                eval(['ProjData.' VarName '=' Aclass '(FieldData.' VarName ');'])%revert to integer values
     1487                            end
     1488                        end
     1489                        eval(['vec_A=reshape(FieldData.' VarName ',[],nbcolor);'])%put the original image in line
     1490                        %ind_in=find(flagin);
     1491                        ind_out=find(~flagin);
     1492                        ICOMB=(XIMA-1)*DimValue(1)+YIMA;
     1493                        ICOMB=ICOMB(flagin);%index corresponding to XIMA and YIMA in the aligned original image vec_A
     1494                        vec_B(flagin,1:nbcolor)=vec_A(ICOMB,:);
     1495                        for icolor=1:nbcolor
     1496                            vec_B(ind_out,icolor)=zeros(size(ind_out));
     1497                        end
    13921498                        ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName VarName];
    13931499                        ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName {DimCell}];
    1394                         ProjData.VarAttribute{length(ProjData.ListVarName)}=FieldData.VarAttribute{ivar}; %reproduce the variable attributes
    1395                         eval(['ProjData.' VarName '=permute(FieldData.' VarName ',ind_new);'])% permute x and z indices for 90 degree rotation
    1396                         eval(['ProjData.' VarName '=squeeze(ProjData.' VarName '(iz,:,:));'])% select the z index iz
    1397                     end
    1398                     eval(['ProjData.' AYProjName '=[Ybound(1) Ybound(2)];']) %record the new (projected ) y coordinates
    1399                     eval(['ProjData.' AXProjName '=[Coord{1}(end),Coord{1}(1)];']) %record the new (projected ) x coordinates
     1500                        if isfield(FieldData,'VarAttribute')&&length(FieldData.VarAttribute)>=ivar
     1501                            ProjData.VarAttribute{length(ProjData.ListVarName)+nbcoord}=FieldData.VarAttribute{ivar};
     1502                        end
     1503                        eval(['ProjData.' VarName '=reshape(vec_B,npY,npX,nbcolor);']);
     1504                    end
     1505                    ProjData.FF=reshape(~flagin,npY,npX);%false flag A FAIRE: tenir compte d'un flga antérieur
     1506                    ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName 'FF'];
     1507                    ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName {DimCell}];
     1508                    ProjData.VarAttribute{length(ProjData.ListVarName)}.Role='errorflag';
     1509                elseif ~testangle
     1510                    % unstructured z coordinate
     1511                    test_sup=(Coord{1}>=ObjectData.Coord(1,3));
     1512                    iz_sup=find(test_sup);
     1513                    iz=iz_sup(1);
     1514                    if iz>=1 & iz<=npz
     1515                        %ProjData.ListDimName=[ProjData.ListDimName ListDimName(2:end)];
     1516                        %ProjData.DimValue=[ProjData.DimValue npY npX];
     1517                        for ivar=VarIndex
     1518                            VarName=FieldData.ListVarName{ivar};
     1519                            ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName VarName];
     1520                            ProjData.VarAttribute{length(ProjData.ListVarName)}=FieldData.VarAttribute{ivar}; %reproduce the variable attributes
     1521                            eval(['ProjData.' VarName '=squeeze(FieldData.' VarName '(iz,:,:));'])% select the z index iz
     1522                            %TODO : do a vertical average for a thick plane
     1523                            if test_interp(2) || test_interp(3)
     1524                                eval(['ProjData.' VarName '=interp2(Coord{3},Coord{2},ProjData.' VarName ',Coord_x,Coord_y'');'])
     1525                            end
     1526                        end
     1527                    end
    14001528                else
    1401                     if NbDim==3
    1402                         DimCell(1)=[]; %suppress z variable
    1403                         DimValue(1)=[];
    1404                         if test_direct(1)
    1405                             iz=ceil((ObjectData.Coord(1,3)-Coord{1}(1))/DZ)+1;
    1406                         else
    1407                             iz=ceil((Coord{1}(1)-ObjectData.Coord(1,3))/DZ)+1;
    1408                         end
    1409                     end
    1410                     max_indy=min(max_indy,DimValue(1));%introduce bounds in y and x indices
    1411                     max_indx=min(max_indx,DimValue(2));
    1412                     for ivar=VarIndex% loop on non coordinate variables
    1413                         VarName=FieldData.ListVarName{ivar};
    1414                         ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName VarName];
    1415                         ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName {DimCell}];
    1416                         if isfield(FieldData,'VarAttribute') && length(FieldData.VarAttribute)>=ivar
    1417                             ProjData.VarAttribute{length(ProjData.ListVarName)}=FieldData.VarAttribute{ivar};
    1418                         end
    1419                         if NbDim==3
    1420                             eval(['ProjData.' VarName '=squeeze(FieldData.' VarName '(iz,min_indy:max_indy,min_indx:max_indx));']);
    1421                         else
    1422                             eval(['ProjData.' VarName '=FieldData.' VarName '(min_indy:max_indy,min_indx:max_indx,:);']);
    1423                         end
    1424                     end
    1425                     eval(['ProjData.' AYProjName '=[Ybound(1) Ybound(2)];']) %record the new (projected ) y coordinates
    1426                     eval(['ProjData.' AXProjName '=[Xbound(1) Xbound(2)];']) %record the new (projected ) x coordinates
    1427                 end
    1428             end
    1429         else       % case with rotation and/or interpolation
    1430             if NbDim==2 %2D case
    1431                 [X,Y]=meshgrid(coord_x_proj,coord_y_proj);%grid in the new coordinates
    1432                 XIMA=ObjectData.Coord(1,1)+(X)*cos(PlaneAngle(3))-Y*sin(PlaneAngle(3));%corresponding coordinates in the original image
    1433                 YIMA=ObjectData.Coord(1,2)+(X)*sin(PlaneAngle(3))+Y*cos(PlaneAngle(3));
    1434                 XIMA=(XIMA-minAX)/DXinit+1;% image index along x
    1435                 YIMA=(-YIMA+maxAY)/DYinit+1;% image index along y
    1436                 XIMA=reshape(round(XIMA),1,npX*npY);%indices reorganized in 'line'
    1437                 YIMA=reshape(round(YIMA),1,npX*npY);
    1438                 flagin=XIMA>=1 & XIMA<=DimValue(2) & YIMA >=1 & YIMA<=DimValue(1);%flagin=1 inside the original image
    1439                 if isequal(ObjectData.ProjMode,'filter')
    1440                     npx_filter=ceil(abs(DX/DAX));
    1441                     npy_filter=ceil(abs(DY/DAY));
    1442                     Mfilter=ones(npy_filter,npx_filter)/(npx_filter*npy_filter);
    1443                     test_filter=1;
    1444                 else
    1445                     test_filter=0;
    1446                 end
    1447                 eval(['ProjData.' AYName '=[coord_y_proj(1) coord_y_proj(end)];']) %record the new (projected ) y coordinates
    1448                 eval(['ProjData.' AXName '=[coord_x_proj(1) coord_x_proj(end)];']) %record the new (projected ) x coordinates
    1449                 for ivar=VarIndex
    1450                     VarName=FieldData.ListVarName{ivar};
    1451                     if test_interp(1) || test_interp(2)%interpolate on a regular grid
    1452                         eval(['ProjData.' VarName '=interp2(Coord{2},Coord{1},FieldData.' VarName ',Coord_x,Coord_y'');']) %TO TEST
    1453                     end
    1454                     %filter the field (image) if option 'filter' is used
    1455                     if test_filter
    1456                         Aclass=class(FieldData.A);
    1457                         eval(['ProjData.' VarName '=filter2(Mfilter,FieldData.' VarName ',''valid'');'])
    1458                         if ~isequal(Aclass,'double')
    1459                             eval(['ProjData.' VarName '=' Aclass '(FieldData.' VarName ');'])%revert to integer values
    1460                         end
    1461                     end
    1462                     eval(['vec_A=reshape(FieldData.' VarName ',[],nbcolor);'])%put the original image in line
    1463                     %ind_in=find(flagin);
    1464                     ind_out=find(~flagin);
    1465                     ICOMB=(XIMA-1)*DimValue(1)+YIMA;
    1466                     ICOMB=ICOMB(flagin);%index corresponding to XIMA and YIMA in the aligned original image vec_A
    1467                     vec_B(flagin,1:nbcolor)=vec_A(ICOMB,:);
    1468                     for icolor=1:nbcolor
    1469                         vec_B(ind_out,icolor)=zeros(size(ind_out));
    1470                     end
    1471                     ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName VarName];
    1472                     ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName {DimCell}];
    1473                     if isfield(FieldData,'VarAttribute')&&length(FieldData.VarAttribute)>=ivar
    1474                         ProjData.VarAttribute{length(ProjData.ListVarName)+nbcoord}=FieldData.VarAttribute{ivar};
    1475                     end
    1476                     eval(['ProjData.' VarName '=reshape(vec_B,npY,npX,nbcolor);']);
    1477                 end
    1478                 ProjData.FF=reshape(~flagin,npY,npX);%false flag A FAIRE: tenir compte d'un flga antérieur
    1479                 ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName 'FF'];
    1480                 ProjData.VarDimName=[ProjData.VarDimName {DimCell}];
    1481                 ProjData.VarAttribute{length(ProjData.ListVarName)}.Role='errorflag';
    1482             elseif ~testangle
    1483                 % unstructured z coordinate
    1484                 test_sup=(Coord{1}>=ObjectData.Coord(1,3));
    1485                 iz_sup=find(test_sup);
    1486                 iz=iz_sup(1);
    1487                 if iz>=1 & iz<=npz
    1488                     %ProjData.ListDimName=[ProjData.ListDimName ListDimName(2:end)];
    1489                     %ProjData.DimValue=[ProjData.DimValue npY npX];
    1490                     for ivar=VarIndex
    1491                         VarName=FieldData.ListVarName{ivar};
    1492                         ProjData.ListVarName=[ProjData.ListVarName VarName];
    1493                         ProjData.VarAttribute{length(ProjData.ListVarName)}=FieldData.VarAttribute{ivar}; %reproduce the variable attributes
    1494                         eval(['ProjData.' VarName '=squeeze(FieldData.' VarName '(iz,:,:));'])% select the z index iz
    1495                         %TODO : do a vertical average for a thick plane
    1496                         if test_interp(2) || test_interp(3)
    1497                             eval(['ProjData.' VarName '=interp2(Coord{3},Coord{2},ProjData.' VarName ',Coord_x,Coord_y'');'])
    1498                         end
    1499                     end
    1500                 end
    1501             else
    1502                 errormsg='projection of structured coordinates on oblique plane not yet implemented';
    1503                 %TODO: use interp3
    1504                 return
    1505             end
    1506         end
     1529                    errormsg='projection of structured coordinates on oblique plane not yet implemented';
     1530                    %TODO: use interp3
     1531                    return
     1532                end
     1533            end
    15071534    end
    15081535   

  • trunk/src/set_object.m

    r477 r491  
    468468    obj_handle=UvData.Object{IndexObj}.DisplayHandle.uvmat;
    469469end
    470 UvData.Object{IndexObj}=ObjectData;
     470UvData.Object{IndexObj}=ObjectData;%record the current object properties in uvmat
    471471if check_handle
    472472    UvData.Object{IndexObj}.DisplayHandle.uvmat=obj_handle; %preserve the object plot handle if valid
    … …  
    474474    UvData.Object{IndexObj}.DisplayHandle.uvmat=hhuvmat.axes3; %axes taken as object display handle by defualt
    475475end
    476 set(hhuvmat.edit_object,'Value',1)% set the current object to edit mode
    477 %     %IndexObj=numel(ListObject)+1;% append an object to the list in uvmat
    478 %     
    479 %     set(hhuvmat.ListObject,'String',[ListObject;{ObjectName}]);%complement the object list
    480 %     set(hhuvmat.ListObject_1,'String',[ListObject;{ObjectName}]);%complement the object list
    481 %     set(hhuvmat.ListObject,'Value',IndexObj)
    482 %     set(hhuvmat.ViewObject,'Value',1)% indicate that the currently selected objected is viewed on set_object
    483 %     UvData.Object{IndexObj}=[];%initiate a new object (empty yet)
    484 %     UvData.Object{IndexObj}.DisplayHandle.uvmat=hhuvmat.axes3; %axes taken as object display handle by defualt
    485 % end
     476%set(hhuvmat.edit_object,'Value',1)% set the current object to edit mode
    486477
    487478%% plot the field projected on the object
    … …  
    497488    end   
    498489    if isequal(IndexObj_1,IndexObj) % if  the projection is in uvmat
    499         PlotType=plot_field(ProjData,hhuvmat.axes3,read_GUI(get(hhuvmat.axes3,'parent')));%update the current uvmat plot
    500     else  % if the projection is in veiw_field
     490         PlotType=plot_field(ProjData,hhuvmat.axes3,read_GUI(get(hhuvmat.axes3,'parent')));%update the current uvmat plot
     491    else  % if the projection is in view_field
    501492        hview_field=findobj(allchild(0),'tag','view_field');
    502493        if isempty(hview_field)
    … …  
    519510            set(hview_field,'Position',Data.GUISize)
    520511        end
    521         set(hhuvmat.ViewField,'Value',1)% indicate that the field projection on the current object is plotted in view_field
     512      %  set(hhuvmat.ViewField,'Value',1)% indicate that the field projection on the current object is plotted in view_field
    522513    end
    523514end
    … …  
    528519if isequal(IndexObj_1,IndexObj)
    529520    %update the representation of the current object for projection field represented in view_field
    530     %     UvData.Object{iobj}.DisplayHandle.view_field=...
    531     %                       plot_object(UvData.Object{IndexObj},UvData.Object{IndexObj_1},UvData.Object{iobj}.DisplayHandle.uvmat,'m');
    532     % update the representation of all objects in uvmat
    533521    for iobj=1:numel(UvData.Object)
    534522        UvData.Object{iobj}.DisplayHandle.uvmat=...
    … …  
    551539    end
    552540end
    553 % UvData.Object{IndexObj}.DisplayHandle.uvmat=plot_object(ObjectData,UvData.Object{IndexObj_1},hobject,'m');%draw the object in uvmat
    554 % if ~isempty(hview_field)
    555 %     if isfield(UvData.Object{IndexObj}.DisplayHandle,'view_field')
    556 %         hobject=UvData.Object{IndexObj}.DisplayHandle.view_field;
    557 %     end
    558 %     if isempty(hobject)
    559 %         hobject=haxes;
    560 %     end   
    561 %     %draw the object in view_field
    562 %     if ~isequal(IndexObj_1,IndexObj) % if  the projection is in uvmat
    563 %     UvData.Object{IndexObj}.DisplayHandle.view_field=plot_object(ObjectData,UvData.Object{IndexObj},hobject,'m');
    564 %     end
    565 % end
    566541set(huvmat,'UserData',UvData)
    567542
    568543%% update the GUI uvmat
    569 hhuvmat=guidata(huvmat);%handles of elements in the uvmat GUI
    570544set(hhuvmat.MenuEditObject,'enable','on')
    571545set(hhuvmat.edit_object,'Value',1) % set uvmat to object edit mode to allow further object update

  • trunk/src/uvmat.m

    r484 r491  
    23582358
    23592359%% calculate scalar
    2360 if isstruct(ParamOut)&&~strcmp(ParamOut.FieldName,'get_field...')&& (strcmp(UvData.FileType{1},'civdata')||strcmp(UvData.FileType{1},'civx'))%&&~strcmp(ParamOut.FieldName,'velocity')&& ~strcmp(ParamOut.FieldName,'get_field...');% ~isequal(ParamOut.CivStage,0)%&&~isempty(FieldName)%
     2360if isstruct(ParamOut)&&~strcmp(ParamOut.FieldName,'get_field...')&& (strcmp(UvData.FileType{1},'civdata')||strcmp(UvData.FileType{1},'civx'))
     2361    if isfield(Field{1},'Coord_tps')
     2362        Field{1}.FieldList=[{ParamOut.FieldName} {ParamOut.ColorVar}];
     2363    else
    23612364    Field{1}=calc_field([{ParamOut.FieldName} {ParamOut.ColorVar}],Field{1});
    2362 end
    2363 if isstruct(ParamOut_1)&& numel(Field)==2 && ~strcmp(ParamOut_1.FieldName,'get_field...')&& ~test_keepdata_1 && (strcmp(UvData.FileType{2},'civdata')||strcmp(UvData.FileType{2},'civx'))  &&~strcmp(ParamOut_1.FieldName,'velocity') && ~strcmp(ParamOut_1.FieldName,'get_field...')
     2365    end
     2366end
     2367if isstruct(ParamOut_1)&& numel(Field)==2 && ~strcmp(ParamOut_1.FieldName,'get_field...')&& ~test_keepdata_1 && (strcmp(UvData.FileType{2},'civdata')||strcmp(UvData.FileType{2},'civx'))...
     2368        &&~strcmp(ParamOut_1.FieldName,'velocity') && ~strcmp(ParamOut_1.FieldName,'get_field...')
     2369    if isfield(Field{2},'Coord_tps')
     2370        Field{2}.FieldList=[{ParamOut_1.FieldName} {ParamOut_1.ColorVar}];
     2371    else
    23642372     Field{2}=calc_field([{ParamOut_1.FieldName} {ParamOut_1.ColorVar}],Field{2});
     2373    end
    23652374end
    23662375
    … …  
    23682377%Field{1}.FieldList=[{ParamOut.FieldName} {ParamOut.ColorVar}];
    23692378if numel(Field)==2
    2370 %    Field{2}.FieldList=[{ParamOut_1.FieldName} {ParamOut_1.ColorVar}];
    23712379   [UvData.Field,errormsg]=sub_field(Field{1},Field{2}); 
    23722380   UvData.Field_1=Field{2}; %store the second field for possible use at next RUN
    … …  
    24952503        UvData.Field.Mesh=ord;
    24962504    end
    2497     UvData.Object{1}.Type='plane';%main plotting plane
    2498     UvData.Object{1}.ProjMode='projection';%main plotting plane
    2499     UvData.Object{1}.DisplayHandle.uvmat=[]; %plane not visible in uvmat
    2500     UvData.Object{1}.DisplayHandle.view_field=[]; %plane not visible in uvmat
    2501    
     2505    % default projection plane
     2506    if ~isfield(UvData,'Object')
     2507        UvData.Object{1}.Type='plane';%main plotting plane
     2508        UvData.Object{1}.ProjMode='projection';%main plotting plane
     2509        UvData.Object{1}.DisplayHandle.uvmat=[]; %plane not visible in uvmat
     2510        UvData.Object{1}.DisplayHandle.view_field=[]; %plane not visible in uvmat
     2511    end
    25022512    %% 3D case (menuvolume)
    25032513    if NbDim==3% && UvData.NewSeries
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.